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Enregistrement W4316662976 · doi:10.1128/spectrum.04673-22

Performance of the Vitek 2 Advanced Expert System (AES) as a Rapid Tool for Reporting Antimicrobial Susceptibility Testing (AST) in <i>Enterobacterales</i> from North and Latin America

2023· article· en· W4316662976 sur OpenAlexfundno aff
Cecília G Carvalhaes, Dee Shortridge, Leah N. Woosley, Nabina Gurung, Mariana Castanheira

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesbioMérieuxIdorsia PharmaceuticalsShionogiBasilea PharmaceuticaAstellas PharmaPfizerMelinta TherapeuticsEntasis TherapeuticsU.S. Food and Drug AdministrationAmplyxRoivant SciencesNabriva TherapeuticsAlbany College of Pharmacy and Health SciencesGenePOCUniversity of North TexasTenNor TherapeuticsBoston PharmaceuticalsNovartisHarvard UniversityF. Hoffmann-La RocheWockhardtAllerganCidara TherapeuticsUniversity of Southern CaliforniaGlaxoSmithKlineBayer
Mots-clésBroth microdilutionAntimicrobialMedicineConfidence intervalMicrobiologyBiologyInternal medicineMinimum inhibitory concentration

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antimicrobial susceptibility testing (AST) reports are one of the most important clinical microbiology laboratory tasks. AST reports are essential to drive antimicrobial therapy, provide information to monitor antimicrobial resistance rates, and trigger further tests to detect outbreaks or confirm new mechanisms of resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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