Cataloging natural sialic acids and other nonulosonic acids (NulOs), and their representation using the Symbol Nomenclature for Glycans
Notice bibliographique
Résumé
Nonulosonic acids or non-2-ulosonic acids (NulOs) are an ancient family of 2-ketoaldonic acids (α-ketoaldonic acids) with a 9-carbon backbone. In nature, these monosaccharides occur either in a 3-deoxy form (referred to as "sialic acids") or in a 3,9-dideoxy "sialic-acid-like" form. The former sialic acids are most common in the deuterostome lineage, including vertebrates, and mimicked by some of their pathogens. The latter sialic-acid-like molecules are found in bacteria and archaea. NulOs are often prominently positioned at the outermost tips of cell surface glycans, and have many key roles in evolution, biology and disease. The diversity of stereochemistry and structural modifications among the NulOs contributes to more than 90 sialic acid forms and 50 sialic-acid-like variants described thus far in nature. This paper reports the curation of these diverse naturally occurring NulOs at the NCBI sialic acid page (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/glycans/sialic.html) as part of the NCBI-Glycans initiative. This includes external links to relevant Carbohydrate Structure Databases. As the amino and hydroxyl groups of these monosaccharides are extensively derivatized by various substituents in nature, the Symbol Nomenclature For Glycans (SNFG) rules have been expanded to represent this natural diversity. These developments help illustrate the natural diversity of sialic acids and related NulOs, and enable their systematic representation in publications and online resources.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».