Homeostasis of Arabidopsis R protein RPS2 is negatively regulated by the RING-type E3 ligase MUSE16
Notice bibliographique
Résumé
The homeostasis of resistance (R) proteins in plants must be tightly regulated to ensure precise activation of plant immune responses upon pathogen infection, while avoiding autoimmunity and growth defects when plants are uninfected. It is known that CPR1, an F-box protein in the SCF E3 complex, functions as a negative regulator of plant immunity through targeting the resistance (R) proteins SNC1 and RPS2 for degradation. However, whether these R proteins are also targeted by other E3 ligases is unclear. Here, we isolated Arabidopsis MUSE16, which encodes a RING-type E3 ligase, from a forward genetic screen and suggest that it is a negative regulator of plant immunity. Unlike CPR1, knocking out MUSE16 alone in Arabidopsis is not enough to result in defense-related dwarfism, since only RPS2 out of the tested R proteins accumulated in the muse16 mutants. Thus, our study identifies a novel E3 ligase involved in the degradation of nucleotide-binding and leucine-rich repeat (NLR) R proteins, support the idea that ubiquitin-mediated degradation is a fine-tuned mechanism for regulating the turnover of R proteins in plants, and that the same R protein can be targeted by different E3 ligases for regulation of its homeostasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».