A “biphasic glycosyltransferase high-throughput screen” identifies novel anthraquinone glycosides in the diversification of phenolic natural products
Notice bibliographique
Résumé
The sugar moieties of many glycosylated small molecule natural products are essential for their biological activity. Glycosyltransferases (GTs) are enzymes responsible for installing these sugar moieties on a variety of biomolecules. Many GTs active on natural products are inherently substrate promiscuous and thus serve as useful tools in manipulating natural product glycosylation to generate new combinations of sugar units (glycones) and scaffold molecules (aglycones) in a process called glycodiversification. It is important to have an effective screening tool to detect the activity of promiscuous enzymes and their resulting glycoside products. Toward this aim, we developed a strategy for screening natural product GTs in a high-throughput fashion enabled by rapid isolation and detection of chromophoric or fluorescent glycosylated natural products. This involves a solvent extraction step to isolate the resulting polar glycoside product from the unreacted aglycone acceptor substrate and the detection of the formed glycoside by the innate absorbance or fluorescence of the aglycone moiety. Using our approach, we screened a collection of natural product GTs against a panel of precursors to therapeutically important molecules. Three GTs showed previously unreported promiscuity toward anthraquinones resulting in novel ε-rhodomycinone glycosides. Considering the pharmaceutical value of clinically used anthraquinone glycosides that are biosynthesized from an ε-rhodomycinone precursor, and the significance that the sugar moiety has on the biological activity of these drugs, our results are of particular importance toward the glycodiversification of therapeutics in this class. The GTs identified and the novel compounds they produce show promise toward new biocatalytic tools and therapeutics.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».