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Enregistrement W4317581866 · doi:10.1101/2023.01.19.524484

Automatic analysis of skull thickness, scalp-to-cortex distance and association with age and sex in cognitively normal elderly

2023· preprint· en· W4317581866 sur OpenAlexfundno aff
Junhao Zhang, Valérie Treyer, Junfeng Sun, Chencheng Zhang, Anton Gietl, Christoph Höck, Daniel Razansky, Roger M. Nitsch, Ruiqing Ni

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCerebrovascular and Carotid Artery Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringHelmut Horten StiftungCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierUniversität ZürichEisaiNorthern California Institute for Research and EducationF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaPfizerBiogenBioClinicaNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbMeso Scale DiagnosticsNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésSkullMagnetic resonance imagingBrain sizeScalpMedicineAnatomyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Personalized neurostimulation has been a potential treatment for many brain diseases, which requires insights into brain/skull geometry. Here, we developed an open source efficient pipeline BrainCalculator for automatically computing the skull thickness map, scalp-to-cortex distance (SCD), and brain volume based on T 1 -weighted magnetic resonance imaging (MRI) data. We examined the influence of age and sex cross-sectionally in 407 cognitively normal older adults (71.9±8.0 years, 60.2% female) from the ADNI. We demonstrated the compatibility of our pipeline with commonly used preprocessing packages and found that BrainSuite Skullfinder was better suited for such automatic analysis compared to FSL Brain Extraction Tool 2 and SPM12- based unified segmentation using ground truth. We found that the sphenoid bone and temporal bone were thinnest among the skull regions in both females and males. There was no increase in regional minimum skull thickness with age except in the female sphenoid bone. No sex difference in minimum skull thickness or SCD was observed. Positive correlations between age and SCD were observed, faster in females (0.307%/y) than males (0.216%/y) in temporal SCD. A negative correlation was observed between age and whole brain volume computed based on brain surface (females -1.031%/y, males -0.998%/y). In conclusion, we developed an automatic pipeline for MR-based skull thickness map, SCD, and brain volume analysis and demonstrated the sex-dependent association between minimum regional skull thickness, SCD and brain volume with age. This pipeline might be useful for personalized neurostimulation planning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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