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Enregistrement W4317600110 · doi:10.1126/sciimmunol.ade7953

A multimorphic mutation in IRF4 causes human autosomal dominant combined immunodeficiency

2023· article· en· W4317600110 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScience Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British ColumbiaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAssistance publique-Hôpitaux de ParisLigue Contre le CancerCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleZhengzhou UniversityFudan UniversityAssistance Publique - Hôpitaux de ParisNational Natural Science Foundation of ChinaNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesKeio UniversityCanada Research ChairsNIH Clinical CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAgence Nationale de la RechercheChildren's Hospital FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftEtablissement Français du SangInstitut des maladies génétiques ImagineVanderbilt University Medical CenterVanderbilt UniversityBC Children's Hospital
Mots-clésIRF4BiologyTranscription factorInterferon regulatory factorsMutationGeneAntibodyMolecular biologyImmunodeficiencyImmune systemImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interferon regulatory factor 4 (IRF4) is a transcription factor (TF) and key regulator of immune cell development and function. We report a recurrent heterozygous mutation in IRF4, p.T95R, causing an autosomal dominant combined immunodeficiency (CID) in seven patients from six unrelated families. The patients exhibited profound susceptibility to opportunistic infections, notably Pneumocystis jirovecii , and presented with agammaglobulinemia. Patients’ B cells showed impaired maturation, decreased immunoglobulin isotype switching, and defective plasma cell differentiation, whereas their T cells contained reduced T H 17 and T FH populations and exhibited decreased cytokine production. A knock-in mouse model of heterozygous T95R showed a severe defect in antibody production both at the steady state and after immunization with different types of antigens, consistent with the CID observed in these patients. The IRF4 T95R variant maps to the TF’s DNA binding domain, alters its canonical DNA binding specificities, and results in a simultaneous multimorphic combination of loss, gain, and new functions for IRF4. IRF4 T95R behaved as a gain-of-function hypermorph by binding to DNA with higher affinity than IRF4 WT . Despite this increased affinity for DNA, the transcriptional activity on IRF4 canonical genes was reduced, showcasing a hypomorphic activity of IRF4 T95R . Simultaneously, IRF4 T95R functions as a neomorph by binding to noncanonical DNA sites to alter the gene expression profile, including the transcription of genes exclusively induced by IRF4 T95R but not by IRF4 WT . This previously undescribed multimorphic IRF4 pathophysiology disrupts normal lymphocyte biology, causing human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,772
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle