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Enregistrement W4317761884 · doi:10.1101/2023.01.23.525163

Caltubin regulates microtubule stability via Ca <sup>2+</sup> -dependent mechanisms favouring neurite regrowth

2023· preprint· en· W4317761884 sur OpenAlexafffund
Andrew Barszczyk, Julia Bandura, Qi Zhang, Haitao Wang, Marielle Deurloo, Yasmin Ahmed, Aiping Dong, Paul Meister, Jeffrey Lee, Hong‐Shuo Sun, Yufeng Tong, Zhong‐Ping Feng

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of WindsorStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuriteMicrotubuleLymnaea stagnalisTubulinCell biologyCalmodulinTyrosineBiologyCalciumChemistryBiochemistrySnail

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Microtubule regulation is highly controlled in nerve regeneration. Caltubin, a novel Lymnaea stagnalis protein, contains putative EF-hand calcium-binding motifs and promotes neuronal outgrowth in Lymnaea and mouse. Here, we generated cell-permeable caltubin proteins to investigate mechanisms underlying this effect. We observed increased neurite extension and outgrowth following injury in caltubin-treated mouse neurons compared to vehicle controls. Purified caltubin bound α-tubulin between its L391-V405 amino acids and promoted microtubule assembly. Caltubin competitively inhibited binding of tubulin tyrosine ligase, which catalyzes tubulin retyrosination, and increased the ratio of detyrosinated to tyrosinated tubulin. Our crystal structure analysis confirmed that caltubin has four Ca 2+ -binding EF-hand motifs, like calmodulin but has distinct peptide binding domains. Our work suggests a unique Ca 2+ -dependent regulatory mechanism of microtubule assembly by caltubin. This may represent an essential mechanism of axonal regulation, which may optimize its activity in response to various calcium states, both physiological and following injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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