Non-syndromic Intellectual Disability: An Experimental In-Depth Exploration of Inheritance Pattern, Phenotypic Presentation, and Genomic Composition
Notice bibliographique
Résumé
Background Intellectual disability (ID), also termed mental retardation (MR), is a neurodevelopmental disorder characterized by an intelligence quotient (IQ) of 70 or below and a deficit in at least two behaviors associated with adaptive functioning. The condition is further classified into syndromic intellectual disability (S-ID) and non-syndromic intellectual disability (NS-ID). This study highlights the genes associated with NS-ID. Objectives A genetic study was performed on two Pakistani families to know the inheritance patterns, clinical phenotypes, and molecular genetics of affected individuals with NS-ID. Methodology Samples were collected from two families: families A and B. All affected individuals in both families were diagnosed by a neurologist. Written informed consent was taken from the affected individuals and guardians before collecting the data and sample. Family A belongs to the Swabi District of Pakistan having four affected individuals, out of whom three were male and one was female. Family B also belongs to the Swabi District of Pakistan having two affected individuals, out of whom one was male and one was female. A total of 10 candidate genes were selected and were further screened by microarray analysis. Results In family A, this analysis identified a region of 9.6 Mb on chromosome 17q11.2-q12 between the single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs953527 and rs2680398. The region was genotyped using microsatellite markers to confirm the haplotypes in all family members. Based on the phenotype-genotype relationship, 10 possible candidate genes were selected out of more than 140 genes in this critical region of 9.6 Mb. In family B, homozygosity mapping through microarray identified four homozygous areas of affected individuals: two (27,324,822-59,122,062 and 96,423,252123,656,241) on chromosome 8, one (14,785,224-19,722,760) on chromosome 9, and one (126173647-126215644) on chromosome 11. Conclusion An autosomal recessive pattern was found in the pedigrees of both families A and B. Phenotypically affected individuals showed IQ levels below 70. Three genes, CDK5R1, OMG, and EV12A, were found on chromosome 17q11.2-q12 region of affected individuals in family A with high expression in the frontal cortex of the brain, hippocampus, and spinal cord, respectively. Other regions on chromosomes 8, 9, and 11 as evident from the affected individuals in family B can also contribute to the non-syndromic autosomal recessive intellectual disability (NS-ARID). Further research is needed to find the association of these genes with intelligence and other neuropsychiatric conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».