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Enregistrement W4317927743 · doi:10.1139/o00-078

The interaction of ferrocytochrome <i>c</i> with long-chain fatty acids and their CoA and carnitine esters

2000· article· en· W4317927743 sur OpenAlexvenueno aff
J.A. Blakely, Malcolm Johnson

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarnitineChemistryCytochrome cStereochemistryLigand (biochemistry)Covalent bondCofactorCytochromeFlavoproteinBiochemistryChromophoreMitochondrionEnzymeOrganic chemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-covalent modification of cytochrome c may have implications for electron transport and energy metabolism. We examined the interaction of various fatty acids (FAs), their coenzyme A and carnitine esters, and fatty alcohols with horse heart ferrocytochrome c. A comparison of FAs indicated a minimum chain length of 14 carbons was required for significant effect on the ferroheme chromophore and major changes in electronic spectra. Coenzyme A and carnitine esters interacted less strongly than FAs whereas long-chain alcohols did not interact with the protein. We found a single, saturable FA binding site with K d (oleate) of 23.1 µM (by stopped-flow kinetics), 30 µM (by radiochemical binding assay), and 29 µM (by spectrophotometric assay). The binding stoichiometry was 1:1. We present evidence from electronic spectra, and proton NMR (nuclear magnetic resonance) that the S–Fe coordination (methionine 80) was disrupted by ligand binding. From molecular modeling we identify a putative binding channel flanked by lysines 72 and 73.Key words: cytochrome c, fatty acids, acyl-CoA, acyl-carnitine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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