Targeting Enterococci with Antimicrobial Activity against Clostridium perfringens from Poultry
Notice bibliographique
Résumé
Necrotic enteritis (NE), caused by Clostridium perfringens, is an emerging issue in poultry farming. New approaches, other than antibiotics, are necessary to prevent NE development and the emergence of multidrug-resistant bacteria. Enterococci are commensal microorganisms that can produce enterocins, antimicrobial peptides with activities against pathogens, and could be excellent candidates for protective cultures. This study aimed to screen and characterize Enterococcus strains of poultry origin for their inhibitory activity against C. perfringens. In total, 251 Enterococcus strains of poultry origin plus five bacteriocin-producing (BP+) E. durans strains of other origins were screened for antimicrobial activity against the indicator C. perfringens X2967 strain using the “spot on the lawn” method. We detected thirty-two BP+ strains (eleven Enterococcus faecium, nine E. gallinarum, eight E. faecalis, three E. durans, and one E. casseliflavus). We further studied the antimicrobial activity of the supernatants of these 32 BP+ strains using agar well diffusion and microtitration against a collection of 20 C. perfringens strains. Twelve BP+ enterococci that were found to exhibit antimicrobial activity against C. perfringens were characterized using whole genome sequencing. Among these, E. faecium X2893 and X2906 were the most promising candidates for further studies as protective cultures for poultry farming. Both strains belong to the sequence type ST722, harbor the genes encoding for enterocin A and enterocin B, do not possess acquired resistance genes, do not carry plasmids, and present the acm gene, which is implicated in host colonization. Further research is needed to determine the utility of these strains as protective cultures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».