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Enregistrement W4318053700 · doi:10.3390/cells12030411

A Lipidomics- and Transcriptomics-Based Analysis of the Intestine of Genetically Obese (ob/ob) and Diabetic (db/db) Mice: Links with Inflammation and Gut Microbiota

2023· article· en· W4318053700 sur OpenAlexafffund
Francesco Suriano, Claudia Manca, Nicolas Flamand, Matthias Van Hul, Nathalie M. Delzenne, Cristoforo Silvestri, Patrice D. Cani, Vincenzo Di Marzo

Notice bibliographique

RevueCells · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesGöteborgs UniversitetStiftelserna Wilhelm och Martina LundgrensCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaFonds De La Recherche Scientifique - FNRSUniversité Laval
Mots-clésLipidomicsOxylipinInflammationBiologyGut floraIntestinal permeabilityTranscriptomeLipid signalingEndocrinologyProinflammatory cytokineInternal medicineGut–brain axisLipid metabolismImmunologyGene expressionBiochemistryMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity is associated with a cluster of metabolic disorders, chronic low-grade inflammation, altered gut microbiota, increased intestinal permeability, and alterations of the lipid mediators of the expanded endocannabinoid (eCB) signaling system, or endocannabinoidome (eCBome). In the present study, we characterized the profile of the eCBome and related oxylipins in the small and large intestines of genetically obese (ob/ob) and diabetic (db/db) mice to decipher possible correlations between these mediators and intestinal inflammation and gut microbiota composition. Basal lipid and gene expression profiles, measured by LC/MS-MS-based targeted lipidomics and qPCR transcriptomics, respectively, highlighted a differentially altered intestinal eCBome and oxylipin tone, possibly linked to increased mRNA levels of inflammatory markers in db/db mice. In particular, the duodenal levels of several 2-monoacylglycerols and N-acylethanolamines were increased and decreased, respectively, in db/db mice, which displayed more pronounced intestinal inflammation. To a little extent, these differences were explained by changes in the expression of the corresponding metabolic enzymes. Correlation analyses suggested possible interactions between eCBome/oxylipin mediators, cytokines, and bacterial components and bacterial taxa closely related to intestinal inflammation. Collectively, this study reveals that db/db mice present a higher inflammatory state in the intestine as compared to ob/ob mice, and that this difference is associated with profound and potentially adaptive or maladaptive, and partly intestinal segment-specific alterations in eCBome and oxylipin signaling. This study opens the way to future investigations on the biological role of several poorly investigated eCBome mediators and oxylipins in the context of obesity and diabetes-induced gut dysbiosis and inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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