A targeted isotope dilution mass spectrometry assay for Osteopontin quantification in plasma of metastatic breast cancer patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Osteopontin (OPN) is a secreted glycophosphoprotein that derives its name from its high abundance in bone and secretion by osteoblasts. It is also secreted by a number of immune cells and, therefore, is present in human plasma at nanogram per millilitre levels where it affects cell adhesion and motility. These properties implicate OPN as a promotor of tumor progression. Plasma OPN is primarily measured by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). However, due to the complexity of the various OPN isoforms, conflicting results have been obtained on the use of OPN as a biomarker even in the same disease condition. These discrepant results may result from the difficulty in comparing ELISA results obtained with different antibodies that target unique OPN epitopes. Mass spectrometry can be used to quantify proteins in plasma and, by targeting OPN regions that do not bear post-translational modifications, may provide more consistent quantification. However, the low (ng/mL) levels in plasma present a significant analytical challenge. In order to develop a sensitive assay for plasma OPN, we explored a single-step precipitation method using a recently developed spin-tube format. Quantification was performed using isotope-dilution mass spectrometry. The concentration detection limit of this assay was 39 ± 15 ng/mL. The assay was applied to the analysis of plasma OPN in metastatic breast cancer patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».