Contrasting Nitrogen Fertilization and<i>Brassica napus</i>(Canola) Variety Development Impact Recruitment of the Root-Associated Microbiome
Notice bibliographique
Résumé
Canola ( Brassica napus) is an important broadacre crop, produced under high nitrogen (N) fertilizer application. Modern canola varieties are developed under high N rates but the impacts on root-associated microbiomes of different varieties are unknown. We studied eight canola varieties spanning historical Canadian spring canola development at two sites under high and low N fertility and characterized bacterial and fungal microbiomes in the root and rhizosphere using amplicon sequencing. Environmental conditions and the resulting canola varietal responses strongly affected the root-associated bacterial and fungal microbiomes. Microbes regulated by N fertility in each canola variety were mainly Gammaproteobacteria, Bacteroidia, Actinobacteria, Sordariomycetes, Dothideomycetes, and Agaricomycetes classes. Differentially abundant (DA) microbial taxa showed that N more strongly enriched bacteria in the roots and fungi in the rhizosphere. Each variety had its specific pattern of DA amplicon sequence variants (ASVs) responding to soil N availability, and the profile of DA-ASVs in paired canola varieties were also altered by soil N availability, especially bacteria in the rhizosphere. The yield was strongly associated with a subset of microbial taxa, mainly from Proteobacteria, Actinobacteriota, and Ascomycota. These variety-dependent responses to N and links to yield performance make the root-associated microbiome a promising target for improving the agronomic performance of canola by manipulating microorganisms tailored to soil fertility and plant genotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».