Does the loss of diadromy imply the loss of salinity tolerance? A gene expression study with replicate nondiadromous populations of <i>Galaxias maculatus</i>
Notice bibliographique
Résumé
The recurrent colonization of freshwater habitats and subsequent loss of diadromy is a major ecological transition that has been reported in many ancestrally diadromous fishes. Such residency is often accompanied by a loss of tolerance to seawater. The amphidromous Galaxias maculatus has repeatedly colonized freshwater streams with evidence that freshwater-resident populations exhibit stark differences in their tolerance to higher salinities. Here, we used transcriptomics to gain insight into the mechanisms contributing to reduced tolerance to higher salinities in freshwater resident populations. We conducted an acute salinity challenge (0 ppt to 23-25 ppt) and measured osmoregulatory ability (muscle water content) over 48 h in three populations: diadromous, saltwater intolerant resident (Toltén), and saltwater tolerant resident (Valdivia). RNA sequencing of the gills identified genes that were differentially expressed in association with the salinity change and associated with the loss of saltwater tolerance in the Toltén population. Key genes associated with saltwater acclimation were characterized in diadromous G. maculatus individuals, some of which were also expressed in the saltwater tolerant resident population (Valdivia). We found that some of these "saltwater acclimation" genes, including the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator gene (CFTR), were not significantly upregulated in the saltwater intolerant resident population (Toltén), suggesting a potential mechanism for the loss of tolerance to higher salinities. As the suite of differentially expressed genes in the diadromous-resident comparison differed between freshwater populations, we hypothesize that diadromy loss results in unique evolutionary trajectories due to drift, so the loss of diadromy does not necessarily lead to a loss in upper salinity tolerance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».