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Enregistrement W4318539439 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjac190.0074

DOP34 Human MD2 deficiency - an inborn error of immunity predisposing to early onset Inflammatory Bowel Disease

2023· article· en· W4318539439 sur OpenAlexaff
Y Li, Ziqi Yu, Madlin Schenk, Irina Lagovsky, David W. Illig, Christoph Walz, Meino Rohlfs, Raffaele Conca, A Muise, Scott B. Snapper, Holm H. Uhlig, B Z Garty, Carmen Klein, Daniel Kotlarz

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTLR4Innate immune systemBiologyImmunologyExome sequencingInduced pluripotent stem cellToll-like receptorLipopolysaccharideImmune systemMutationGeneticsGeneEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Pattern recognition receptors (PRRs) serve as a hub of immune responses to microbes in the gut and play a critical role in maintaining intestinal homeostasis. Toll-like receptor 4 (TLR4) represents an important PRR that can recognize the gram-negative bacterial cell wall component lipopolysaccharide (LPS). Upon binding to LPS, TLR4 forms a multimeric complex with the indispensable co-receptor myeloid differentiation protein 2 (MD2) facilitating selection of TLR4 as cargo for endocytosis and TLR4-mediated activation of downstream signalling. Despite the critical role of TLR4 in innate immunity, no patients with TLR4 or MD2 deficiency have yet been reported. Methods To investigate potential genetic causes for two related patients presenting with very early onset Inflammatory Bowel Disease (VEO-IBD) and/or pneumonia, we have performed whole exome sequencing (WES). To assess the functional consequences of the identified LY96 (encoding for MD2) variant, we generated a CRISPR/Cas9-mediated knockout (KO) of MD2 or knockin (KI) of the patient mutation in induced pluripotent stem cells (iPSCs) and studied TLR4-mediated signalling, cytokine responses, and bacterial handling in iPSC-derived macrophages. Results Genetic analysis identified a 3 bp homozygous in-frame deletion in the LY96 gene (NM_015364.5, c.347_349delCAA; p.Thr116del) in our index patients following an autosomal recessive inheritance pattern. Immunoblotting revealed an altered protein expression of overexpressed Flag-tagged mutant MD2 protein due to impaired N-linked glycosylation. Correspondingly, iPSC-derived MD2-deficient macrophages showed an impaired LPS-induced TLR4 endocytosis. As a functional consequence, we could detect reduced NF-κB and MAPK signalling (phosphorylation of NF-κB p65 subunit, ERK1/2, and p38 MAPK) and dysregulated inflammasome activation (IL-1b production and secretion) upon challenge with LPS. Gentamycin protection assays and live cell imaging suggested that MD2-deficient macrophages exhibit an impaired phagocytosis of microbial pathogens. In addition, macrophages with mutant MD2 showed decreased cytokine expression (e.g., IFNB, IL6, IL10, and TNF) in response to LPS or gram-negative bacteria (E. coli and Salmonella typhimurium) but not gram-positive bacteria (Listeria monocytogenes). Conclusion Human MD2 deficiency is an inborn error of immunity that may predispose to VEO-IBD associated with altered TLR4-mediated signalling, cytokine responses, and bacterial handling. The first description of patients with MD2 deficiency provides critical insights on human TLR4/MD2 biology and warrants caution on therapeutics strategies targeting TLR4 signalling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,713
Score d'incertitude au seuil0,626

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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