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Enregistrement W4318539780 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjac190.0056

DOP16 Anti-integrin αvβ6 autoantibodies predate Ulcerative Colitis diagnosis by up to 10 years and are associated with adverse disease-related outcomes

2023· article· en· W4318539780 sur OpenAlexaffabout
Alexandra E. Livanos, Andrew Dunn, J Fischer, Ryan C. Ungaro, Williams Turpin, S H Lee, Sew Xin Rui, Diane M. Del Valle, Julia Jougon, Gustavo Martínez-Delgado, Mark S. Riddle, Joseph A. Murray, Renée M. Laird, J Torres, Manasi Agrawal, Jared Magee, Thierry Dervieux, Sacha Gnjatic, D. Sheppard, B E Sands, Chad K. Porter, Kenneth Croitoru, Francesca Petralia, J F Colombel, Saurabh Mehandru

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUlcerative colitisMedicineCohortInternal medicineAutoantibodyInflammatory bowel diseaseAsymptomaticGastroenterologyDiseaseAdverse effectImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Biomarkers for predicting the development of Ulcerative Colitis (UC) and disease-related complications are lacking. Anti-integrin αvβ6 IgG autoantibodies (anti-αvβ6) have been recently described in patients diagnosed with UC. Here, we sought to determine if anti-αvβ6 autoantibodies predate UC development and to study associations between anti-αvβ6 and disease outcomes in newly diagnosed UC patients. Methods In a unique pre-clinical IBD cohort from the PRoteomic Evaluation and Discovery in an IBD Cohort of Tri-service Subjects (PREDICTS), anti-αvβ6 were measured in longitudinal pre-diagnosis serum samples from 82 subjects who later developed UC as well as in 82 matched subjects that did not develop IBD (HC). Sample A was at the time of UC diagnosis, Sample B was at a median of 2 years before Sample A, Sample C was at a median of 4 years before Sample A and Sample D was at a median of 10 years before Sample A. In a distinct, external validation cohort (the Crohn’s and Colitis Canada Genetics Environment Microbial (GEM) Project), we tested samples from 12 subjects who later developed UC and compared those with 49 matched subjects who remained asymptomatic. Further, anti-αvβ6 were measured in 2 incident IBD cohorts (COMPASS, n=55 and OSCCAR, n=104 UC subjects) and associations between anti-αvβ6 and adverse UC-outcomes were defined using Cox proportional-hazards model. Results Anti-αvβ6 were significantly higher in the PREDICTS cohort among individuals who developed UC compared to HC up to 10 years prior to diagnosis (Figure 1A). The anti-αvβ6 seropositivity was 12.2% 10 years before diagnosis and increased to 52.4% at the time of diagnosis in subjects who developed UC compared with 2.7% in controls across the 4 timepoints. Additionally, the predictive performance of anti-αvβ6 autoantibodies as assessed via area under the receiver operator curves (AUROC) with 10-fold cross validation was at least 0.8 up to 10 years before diagnosis (Figure 1B). Elevated levels of anti-αvβ6 in pre-clinical UC samples were further validated in the GEM cohort (Figure 1C). Finally, high anti-αvβ6 were associated with a composite of adverse UC-outcomes including hospitalization, disease extension, colectomy, systemic steroid use and/or escalation to biologic therapy in both incident cohorts (Figure 1D). Conclusion Anti-integrin αvβ6 autoantibodies precede the clinical diagnosis of UC by up to 10 years and are associated with adverse UC-related outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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