P318 Protein FingerPrint assays reflecting neutrophil activity, mucosal damage, and tissue fibrosis are surrogate biomarkers for mucosal healing in pediatric Crohn’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Mucosal healing (MH) has become a treatment goal for inflammatory bowel disease (IBD), especially for ulcerative colitis. However, MH is less feasible to assess frequently in patients with Crohn’s disease (CD). In this study, we investigated Protein Fingerprint Assays (PFA) of collagen degradation and formation, and neutrophil and macrophage activity markers in the ImageKids study as non-invasive markers of MH. Methods This is a proteomics planned sub-study of the multi-center prospective ImageKids study which included serum samples from children with CD (n=178) undergoing MRE and ileocolonoscopy concurrently (ImageKids study: NCT01881490). Serum from healthy age and gender-matched controls were obtained from BioIVT (n=83). PFA panel for mucosal damage (C1M, C3M, C4M, C6M, ELP-3), Immune cell activity panel (CPa9-HNE, VICM, C4G), and tissue fibrosis panel (PRO-C1, PRO-C3, PRO-C4, PRO-C5, PRO-C6, PRO-C11, PRO-C22) were determined. MH was classified as having an SES-CD score of 0 and global radiologist assessment of inflammation in the MRE of 0, using a visual analogue scale (VAS) 0-100mm, and mucosal damage (MD) was defined as having SES-CD or MRE VAS>0. Spearman rho correlations, one-way ANOVA with Tukey correction, and receiver operator characteristics (ROC) curves were applied for statistical analysis. Results Some of the previous biomarkers demonstrated to correlate with the SES-CD score and ulcer size (C1M, C3M, C6M, PRO-C4, VICM, PRO-C1, PRO-C3). CPa9-HNE, ELP-3, and PRO-C22 also correlate with the SES-CD score (table 1). The combined SES-CD and MRE VAS score of MH correlated positively with CPa9-HNE (r=0.30, p<0.0001), VICM (r=0.39, p<0.0001), C1M (r=0.29, p=0.0001), C3M (r=0.22, p=0.0022), C6M (r=0.35 p<0.0001), PRO-C4 (r=0.2, p<0.0001), PRO-C22 (r=0.32, p<0.0001), (figure 1 and 2) and showed significantly lower serum levels in pCD patients with MH compared to patients with mild, moderate, or severe mucosal damage (p<0.001) (figure 2). PRO-C3 correlated negatively with the combined SES-CD and MRE VAS score (r=-0.17, p=0.0211). These PFA biomarkers were combined in a multivariate regression model, demonstrating increased accuracy to identify patients in MH healing compared to the individual biomarkers (p<0.001, MH vs. MD: AUC=0.82 [CI:0.69-0.95), MH+Mild MD vs. moderate+severe MD: AUC=0.77 [0.70-0.84], (figure 3). Conclusion PFA biomarkers of Neutrophil activity (CPa9-HNE), Macrophage activity (VICM), mucosal damage (C1M, C3M, C4M, C6M, ELP-3), and tissue fibrosis (PRO-C3, PRO-C22) are potential surrogate biomarkers for identifying pCD patients with mucosal healing and for monitoring of mucosal damage and stenosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».