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Enregistrement W4318577082 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjac190.0907

P777 Deployment of an artificial intelligence tool for precision medicine in ulcerative colitis: Preliminary data from 8 globally distributed clinical sites

2023· article· en· W4318577082 sur OpenAlexaff
Laurent Peyrin‐Biroulet, Daniel S. Rubin, Christopher R. Weber, Shashi Adsul, Marina Lopes Freitas de Freire, Luc Biedermann, Viktor H. Koelzer, Brian Bressler, Jan Hendrik Niess, Madlaina Matter, Uri Kopylov, Iris Barshack, Fernando Magro, Fátima Carneiro, N Maharshak, A Greenberg, Sara Hart, Jashmid Dehmeshki, Olga Kubassova

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArtificial intelligenceConfusion matrixComputer scienceMachine learningPopulationConvolutional neural networkAutomated methodRobustness (evolution)ConfusionPattern recognition (psychology)Medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Histological remission is an important target for Ulcerative Colitis (UC) treatment; however, scoring of histological images is time-consuming and prone to inter and intra-observer variability. Thus, a need exists for an accurate, reproducible, and reliable automated method. Previously, we demonstrated an Artificial Intelligence (AI) Tool using image processing and machine learning algorithms to measure histological disease activity using the Nancy index consistently and accurately.1 Here, we aim to enhance the capabilities of the AI Tool, by adding substantially more population-diversified training data while maintaining accuracy and robustness of results. Methods Eight global sites submitted 600 UC histological images. These were added to the 200 images previously used to train and validate the AI Tool. The 800-image dataset was divided into 2 groups: 90% used for training, 10% for testing. The novel AI algorithms were trained using state-of-the-art image processing and machine learning techniques based on deep learning and feature extraction. Cell and tissue regions of each training image were manually annotated, measured, and assigned a Nancy Index independently by 3 histopathologists, and used to further train the AI using over 43,000 characterisations. The AI Tool fully characterises histological images, identifying tissue types, cell types, cell numbers and locations, and automatically measures the Nancy Index for each image. Intra Class Correlation (ICC) and Confusion Matrix analyses were performed to evaluate the AI Tool and assess accuracy. Results The average ICC was 92.1% among the histopathologists and 91.1% between histopathologists and AI Tool, compared with 88.3% and 87.2% in the previous study.1 Confusion matrix analysis (Table 1) demonstrated the strongest correlation at the extremes of the Nancy Index, with 80% correlation between predicted and true labels for Nancy Scores of 0 or 4. When 2 adjacent scores were combined, correlations were stronger: 96% for a true Nancy score of 0 being predicted as 0 or 1, and 100% for a true Nancy score of 2 being predicted as 2 or 3. Conclusion By adding a larger number of images to the AI Tool training data, the robustness of the AI Tool was substantially improved while maintaining accuracy. The continued high correlation of AI Tool performance with the histopathologists reinforces the potential role for the AI Tool for IBD clinical applications. Fully characterising whole slides could standardise and validate an AI-driven scoring system for histology slides in IBD, eliminating the subjectivity of the human pathologist in assessment of disease activity. References: 1. Peyrin-Biroulet L, et al. J Crohn's and Colitis. 2022;16(Suppl 1):i105.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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