Association of a <i>FAM13A</i> variant with interstitial lung disease in Japanese rheumatoid arthritis
Notice bibliographique
Résumé
Background Interstitial lung disease (ILD) occasionally occurs in rheumatoid arthritis (RA) and confers a dismal prognosis. We previously reported that a single-nucleotide variant (SNV) of MUC5B was associated with ILD in RA. However, the pathogenesis of ILD in Japanese patients with RA could not be explained solely by this SNV because its frequency is extremely low in the Japanese population. Here, we examined whether a different idiopathic pulmonary fibrosis susceptibility SNV might be associated with ILD in Japanese patients with RA. Methods Genotyping of rs2609255 (G/T) in FAM13A was conducted in 208 patients with RA with ILD and 420 without chronic lung disease using TaqMan assays. Results A significant association with usual interstitial pneumonia (UIP) in RA was detected for rs2609255 under the allele model (p=0.0092, Pc=0.0276, OR 1.53, 95% CI 1.12 to 2.11) and recessive model for the G allele (p=0.0003, Pc=0.0009, OR 2.63, 95% CI 1.59 to 4.32). FAM13A rs2609255 was significantly associated with UIP in male patients with RA (p=0.0043, OR 3.65, 95% CI 1.52 to 8.73) under the recessive model. Conclusions This study is the first to document an association of rs2609255 with ILD in Japanese patients with RA, implicating it in the pathogenesis of UIP, though studies on the function of rs2609255 are warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».