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Enregistrement W4318695000 · doi:10.1117/1.jmi.10.1.017501

Single patch super-resolution of histopathology whole slide images: a comparative study

2023· article· en· W4318695000 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Imaging · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMagnificationHistopathologyArtificial intelligenceDigital pathologyImage resolutionImage qualityComputer scienceMedicinePixelDigital imagingComputer visionDigital imageDeep learningImage processingPattern recognition (psychology)Medical physicsImage (mathematics)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PurposeThe latest generation of scanners can digitize histopathology glass slides for computerized image analysis. These images contain valuable information for diagnostic and prognostic purposes. Consequently, the availability of high digital magnifications like 20 × and 40 × is commonly expected in scanning the slides. Thus, the image acquisition typically generates gigapixel high-resolution images, times as large as 100,000 × 100,000 pixels. Naturally, the storage and processing of such huge files may be subject to severe computational bottlenecks. As a result, the need for techniques that can operate on lower magnification levels but produce results on par with outcomes for high magnification levels is becoming urgent.ApproachOver the past decade, the digital solution of enhancing images resolution has been addressed by the concept of super resolution (SR). In addition, deep learning has offered state-of-the-art results for increasing the image resolution after acquisition. In this study, multiple deep learning networks designed for image SR are trained and assessed for the histopathology domain.ResultsWe report quantitative and qualitative comparisons of the results using publicly available cancer images to shed light on the benefits and challenges of deep learning for extrapolating image resolution in histopathology. Three pathologists evaluated the results to assess the quality and diagnostic value of generated SR images.ConclusionsPixel-level information, including structures and textures in histopathology images, are learnable by deep networks; hence improving the resolution quantity of scanned slides is possible by training appropriate networks. Different SR networks may perform best for various cancer sites and subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,829
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle