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Enregistrement W4318701474 · doi:10.1038/s41598-022-26962-w

The physician factor and anatomical site in 8846 consecutive mediastinal lymph node aspirations in a cross-sectional study

2023· article· en· W4318701474 sur OpenAlexafffund
Michael Bonert, Uzma Zafar, Soha Ramadan, Christian Finley, Jean‐Claude Cutz, Gary D. Foster, Kjetil Ask, Asghar Naqvi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensImpactMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésMedicineLymph nodeRadiologySurgical pathologyFine-needle aspirationLogistic regressionEndoscopic ultrasoundBiopsyPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mediastinal lymph node fine needle aspiration (MLN-FNA) is a common procedure; however, the physician factor in pathological category, and anatomical site are not routinely assessed. Cytology reports for endobronchial ultrasound (EBUS)/endoscopic ultrasound (EUS) MLN-FNA specimens (8846) were retrieved for July 2012-Dec 2019, classified by hierarchical free text string match algorithm into 51 diagnostic categories, four mutually exclusive diagnostic groups (benign |suspicious |malignant |insufficient), and 24 anatomical sites. Pathologist and submitting physician/surgeon bias were assessed using logistic regression and funnel plots|control charts centered on the group median (diagnostic/capture) rate. Eleven pathologists and seven submitting physician/surgeon were involved in more than 250 specimens each. Overall, the MLN-FNAs were benign|suspicious|malignant|insufficient in 46%|4%|25%|24% of specimens. Percent malignant (number of samples) varied by station; 7| 4R| 4L| 2R| 10R| 11R| 11L were respectively 21%(3,101), 27%(2,453), 19%(1,289), 41%(435), 27%(497), 24%(357), 26%(229). The number of outlier (P < 0.05/P < 0.001) pathologists of 11 from the group median rate for benign|suspicious|malignant|insufficient was 0/0| 3/1| 0/0| 3/0 respectively. The outlier (P < 0.05/P < 0.001) submitting physicians/surgeons of 7 for benign|suspicious|malignant|insufficient was 3/2| 2/2| 3/2| 3/2 respectively. The physician and anatomical site are significant predictors of MLN-FNA pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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