IL-1 Polymorphism and Helicobacter pylori Infection Features: Highlighting VNTR’s Potential in Predicting the Susceptibility to Infection-Associated Disease Development
Notice bibliographique
Résumé
Genetic polymorphisms at the IL-1 cluster are associated with increased Helicobacter pylori (H. pylori)-associated disease risk in an ethnically dependent manner. Due to the corroborated role of IL-1β in H. pylori infection progression, our aim is to depict the impact of IL1B rs1143627 and rs16944 as well as the IL1RN variable number of identical tandem repeats (VNTR) on the clinical and biological features of Moroccan H. pylori-infected patients. A total of 58 patients with epigastralgic pain were referred to the gastroenterology department for histopathological and clinical analysis. DNA extraction from antrum and fundus biopsies and PCR–RFLP were performed to detect polymorphisms. As a result, VNTR was significantly associated with IL-1β antrum levels (p-value = 0.029), where the *1/*4 genotype showed a positive association with upregulated cytokine levels in the antrum and was clustered with H. pylori-infected patients’ features and higher levels of IL-1β in the antrum and fundus. Likewise, *1/*1 genotype carriers clustered with severe gastritis activity and H. pylori density scores along with low levels of IL-1β in the antrum and fundus, while the *1/*2 genotype was clustered with non-infected-patient features and normal IL-1β levels. In conclusion, VNTR might be an interesting predictor to identify patients at risk of developing H. pylori-associated pathologies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».