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Enregistrement W4318706039 · doi:10.3390/microorganisms11020353

IL-1 Polymorphism and Helicobacter pylori Infection Features: Highlighting VNTR’s Potential in Predicting the Susceptibility to Infection-Associated Disease Development

2023· article· en· W4318706039 sur OpenAlexafffund
Hajar El Filaly, Ahmed Outlioua, Christophe Desterke, Echarki Zerif, Wafaa Badre, M. Rabhi, Myriam Riyad, Damien Arnoult, Abdelouahed Khalil, Khadija Akarid

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAgence Universitaire de la FrancophonieMinistère des relations internationales et de la Francophonie
Mots-clésHelicobacter pyloriGenotypeAntrumGastritisGastroenterologyBiologyInternal medicineDiseaseRestriction fragment length polymorphismVariable number tandem repeatImmunologyMedicineStomachGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic polymorphisms at the IL-1 cluster are associated with increased Helicobacter pylori (H. pylori)-associated disease risk in an ethnically dependent manner. Due to the corroborated role of IL-1β in H. pylori infection progression, our aim is to depict the impact of IL1B rs1143627 and rs16944 as well as the IL1RN variable number of identical tandem repeats (VNTR) on the clinical and biological features of Moroccan H. pylori-infected patients. A total of 58 patients with epigastralgic pain were referred to the gastroenterology department for histopathological and clinical analysis. DNA extraction from antrum and fundus biopsies and PCR–RFLP were performed to detect polymorphisms. As a result, VNTR was significantly associated with IL-1β antrum levels (p-value = 0.029), where the *1/*4 genotype showed a positive association with upregulated cytokine levels in the antrum and was clustered with H. pylori-infected patients’ features and higher levels of IL-1β in the antrum and fundus. Likewise, *1/*1 genotype carriers clustered with severe gastritis activity and H. pylori density scores along with low levels of IL-1β in the antrum and fundus, while the *1/*2 genotype was clustered with non-infected-patient features and normal IL-1β levels. In conclusion, VNTR might be an interesting predictor to identify patients at risk of developing H. pylori-associated pathologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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