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Enregistrement W4318706872 · doi:10.1101/2023.01.28.23285147

Large scale genome-wide association analyses identify novel genetic loci and mechanisms in hypertrophic cardiomyopathy

2023· preprint· en· W4318706872 sur OpenAlexafffund
Rafik Tadros, Sean Zheng, Christopher Grace, Paloma Jordà, Catherine Francis, Sean J. Jurgens, Kate Thomson, Andrew R. Harper, Elizabeth Ormondroyd, Dominique M West, Xiao Yun Xu, Pantazis Theotokis, Rachel Buchan, Kathryn A. McGurk, Francesco Mazzarotto, Beatrice Boschi, Elisabetta Pelo, Michael Lee, Michela Noseda, Amanda Varnava, Alexa M.C. Vermeer, Roddy Walsh, Ahmad S. Amin, Marjon A. van Slegtenhorst, Nicole M. Roslin, Lisa J. Strug, Erika Salvi, Chiara Lanzani, Antonio de Marvao, Jason D. Roberts, Maxime Tremblay‐Gravel, Geneviève Giraldeau, Julia Cadrin‐Tourigny, Philippe L. L’Allier, Patrick Garceau, Mario Talajic, Yigal M. Pinto, Harry Rakowski, Antonis Pantazis, John Baksi, Brian P. Halliday, Sanjay Prasad, Paul J.R. Barton, Declan P. O’Regan, Stuart A. Cook, Rudolf A. de Boer, Imke Christiaans, Michelle Michels, Christopher M. Kramer, Carolyn Y. Ho, Stefan Neubauer, Paul M. Matthews, Arthur A.M. Wilde, Jean‐Claude Tardif, Iacopo Olivotto, Arnon Adler, Anuj Goel, James S. Ware, Connie R. Bezzina, Hugh Watkins

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity Health NetworkSickKids FoundationUniversity of TorontoUniversité de MontréalHospital for Sick ChildrenMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesAmsterdam Cardiovascular Sciences, Amsterdam University Medical CentersNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteUK Dementia Research InstituteMedical Research CouncilInstitut de Cardiologie de MontréalFondation Institut de Cardiologie de MontréalAmsterdam University Medical CentersFondation LeducqDeutsches Zentrum für Herz-KreislaufforschungEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchImperial College LondonNational Institute for Health and Care ResearchZonMwNovo Nordisk FondenIsrael Cancer Research FundWellcome TrustAlzheimer's SocietyBritish Heart Foundation
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyGenome-wide association studyMendelian randomizationGenetic associationDiseaseBiologyGeneticsCardiomyopathyInternal medicineGeneMedicineGenetic variantsGenotypeSingle-nucleotide polymorphismHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is an important cause of morbidity and mortality with both monogenic and polygenic components. We here report results from the largest HCM genome-wide association study (GWAS) and multi-trait analysis (MTAG) including 5,900 HCM cases, 68,359 controls, and 36,083 UK Biobank (UKB) participants with cardiac magnetic resonance (CMR) imaging. We identified a total of 70 loci (50 novel) associated with HCM, and 62 loci (32 novel) as sociated with relevant left ventricular (LV) structural or functional traits. Amongst the common variant HCM loci, we identify a novel HCM disease gene, SVIL , which encodes the actin-binding protein supervillin, showing that rare truncating SVIL variants cause HCM. Mendelian randomization analyses support a causal role of increased LV contractility in both obstructive and non-obstructive forms of HCM, suggesting common disease mechanisms and anticipating shared response to therapy. Taken together, the findings significantly increase our understanding of the genetic basis and molecular mechanisms of HCM, with potential implications for disease management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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