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Enregistrement W4318712544 · doi:10.1002/pld3.482

<i>Populus</i> endo‐glucanase 16 localizes to the cell walls of developing tissues

2023· article· en· W4318712544 sur OpenAlexafffund
Hila Behar, Yaseen Mottiar, Rohan Chandrasekhar, Allegra Corelli Grappadelli, Markus Pauly, Lacey Samuels, Shawn D. Mansfield, Harry Brumer

Notice bibliographique

RevuePlant Direct · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British ColumbiaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésGlucanaseCell wallCell biologyChemistryBiologyBotanyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The hemicelluloses comprise a group of matrix glycans that interact with cellulose microfibrils in plant cell walls and play important roles in establishing wall architecture. The structures of hemicelluloses are determined by carbohydrate‐active enzymes (CAZymes) that synthesize, integrate, and break down these polymers. Specifically, endo‐glucanase 16 (EG16) enzymes, which are related to the well‐known xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase ( XTH ) gene products in Glycoside Hydrolase Family 16 (GH16), have been implicated in the degradation of the β(1,4)‐linked backbone of mixed‐linkage β(1,3);β(1,4)‐glucans (MLG) and xyloglucans. EG16 members are single‐copy genes found in most plant clades but are absent from many eudicots, including the model plant Arabidopsis thaliana . Until recently, EG16 members had only been characterized in vitro, establishing their substrate specificity, protein structure, and phylogenetic history, but their biological function was unknown. Here we used a hybrid polar, Populus alba × Populus grandidentata (P39), as a model to examine EG16 expression, subcellular localization, and pheno‐ and chemotypes of EG16 ‐downregulated P39 plants. Populus EG16 expression is strong in young tissues, but RNAi‐mediated downregulation did not impact plant growth nor the fine structure of the hemicellulose xyloglucan, suggesting a restricted or currently unknown role in angiosperm physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,402
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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