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Enregistrement W4318761203 · doi:10.1016/j.mex.2023.102051

An optimized and validated protocol for the purification of PDGFRα+ oligodendrocyte precursor cells from mouse brain tissue via immunopanning

2023· article· en· W4318761203 sur OpenAlexafffund
Julia Macintosh, Mackenzie A. Michell‐Robinson, Xiaoru Chen, Daryan Chitsaz, Timothy E. Kennedy, Geneviève Bernard

Notice bibliographique

RevueMethodsX · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Health, University of SydneyCanadian Institutes of Health ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéFonds de recherche du QuébecFaculty of Science, Medicine and HealthCanada First Research Excellence FundMultiple Sclerosis SocietyFondation de l'Hôpital de Montréal pour enfantsCase Western Reserve UniversityChildren's Hospital FoundationMultiple Sclerosis Society of CanadaMcGill UniversityFaculty of Medicine, McGill University
Mots-clésOligodendrocytePlatelet-derived growth factor receptorCell biologyBiologyIn vivoPlatelet-derived growth factorNeural stem cellStem cellChemistryNeuroscienceGrowth factorMolecular biologyReceptorBiochemistryCentral nervous systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immunopanning is an efficient and reliable method for isolating primary cells from rodent brain tissue, making it a valuable tool for researchers interested in in vitro glial models. Here, we present an immunopanning protocol optimized for the isolation of Platelet-Derived Growth Factor Receptor Alpha positive (PDGFRα+) oligodendrocyte precursor cells (OPCs) from mouse brain tissue that results in a high yield of pure OPCs from minimal quantities of starting tissue. •The protocol presented here is optimized for a PDGFRα-dependent selection of mouse OPCs using a commercial antibody, accounting for the relatively weaker adhesion of OPCs to the anti-PDGFRα plate as compared to other oligodendrocyte lineage markers (e.g., MOG). •A modified papain digestion step, with 95% O 2 /5% CO 2 gas that is humidified prior to perfusion, significantly enhances the yield of dissociated cells and final yield of OPCs. •Isolating OPCs at the PDGFRα+ stage permits the expansion of cells in culture, facilitating studies using transgenic mice, and enables studies on the development of the oligodendrocyte lineage without the spatial and temporal complexity of in vivo studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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