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Enregistrement W4318765531 · doi:10.1126/scitranslmed.abq6024

Epigenetic modification of <i>CSDE1</i> locus dictates immune recognition of nascent tumorigenic cells

2023· article· en· W4318765531 sur OpenAlexaff
Jiadi Lv, Yabo Zhou, Nannan Zhou, Zhenfeng Wang, Jie Chen, Haoran Chen, Dianheng Wang, Li Zhou, Keke Wei, Huafeng Zhang, Ke Tang, Jingwei Ma, Yuying Liu, Yonghong Wan, Yi Zhang, Haizeng Zhang, Bo Huang

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyImmune systemCancer researchImmunosurveillanceCell biologyCancer immunotherapyImmunotherapyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Weak immunogenicity of tumor cells is a root cause for the ultimate failure of immunosurveillance and immunotherapy. Although tumor evolution can be shaped by immunoediting toward a less immunogenic phenotype, mechanisms governing the initial immunogenicity of primordial tumor cells or original cancer stem cells remain obscure. Here, using a single tumor-repopulating cell (TRC) to form tumors in immunodeficient or immunocompetent mice, we demonstrated that immunogenic heterogeneity is an inherent trait of tumorigenic cells defined by the activation status of signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1) protein in the absence of immune pressure. Subsequent investigation identified that the RNA binding protein cold shock domain–containing protein E1 (CSDE1) can promote STAT1 dephosphorylation by stabilizing T cell protein tyrosine phosphatase (TCPTP). A methyltransferase SET and MYN domain–containing 3 (SMYD3) was further identified to mediate H3K4 trimethylation of CSDE1 locus, which was under the regulation of mechanotransduction by cell-matrix and cell-cell contacts. Thus, owing to the differential epigenetic modification and subsequent differential expression of CSDE1, nascent tumorigenic cells may exhibit either a high or low immunogenicity. This identified SMYD3-CSDE1 pathway represents a potential prognostic marker for cancer immunotherapy effectiveness that requires further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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