MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4318817212 · doi:10.1038/s41586-022-05680-3

Single-cell spatial immune landscapes of primary and metastatic brain tumours

2023· article· en· W4318817212 sur OpenAlexafffund
Elham Karimi, Miranda W. Yu, Sarah M. Maritan, Lucas J. M. Perus, Morteza Rezanejad, Mark Sorin, Matthew Dankner, Parvaneh Fallah, Samuel Doré, Dongmei Zuo, Benoit Fiset, Daan J. Kloosterman, LeeAnn Ramsay, Yuhong Wei, Stéphanie Lam, Roa Alsajjan, Ian R. Watson, Gloria Roldan Urgoiti, Morag Park, Dieta Brandsma, Donna L. Senger, Jennifer A. Chan, Leila Akkari, Kevin Petrecca, Marie‐Christine Guiot, Peter M. Siegel, Daniela F. Quail, Logan A. Walsh

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill University Health CentreUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityUniversity of CalgaryJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsMcGill UniversityTerry Fox Research InstituteWorld Health Organization
Mots-clésMass cytometryImmune systemBiologyContext (archaeology)CellGliomaCancer researchPopulationTumor microenvironmentPathologyImmunologyPhenotypeMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Single-cell technologies have enabled the characterization of the tumour microenvironment at unprecedented depth and have revealed vast cellular diversity among tumour cells and their niche. Anti-tumour immunity relies on cell–cell relationships within the tumour microenvironment 1,2 , yet many single-cell studies lack spatial context and rely on dissociated tissues 3 . Here we applied imaging mass cytometry to characterize the immunological landscape of 139 high-grade glioma and 46 brain metastasis tumours from patients. Single-cell analysis of more than 1.1 million cells across 389 high-dimensional histopathology images enabled the spatial resolution of immune lineages and activation states, revealing differences in immune landscapes between primary tumours and brain metastases from diverse solid cancers. These analyses revealed cellular neighbourhoods associated with survival in patients with glioblastoma, which we leveraged to identify a unique population of myeloperoxidase (MPO)-positive macrophages associated with long-term survival. Our findings provide insight into the biology of primary and metastatic brain tumours, reinforcing the value of integrating spatial resolution to single-cell datasets to dissect the microenvironmental contexture of cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,633
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations392
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNatureMême sujetGlioma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207