Effect of azoxystrobin on tobacco leaf microbial composition and diversity
Notice bibliographique
Résumé
Azoxystrobin, a quinone outside inhibitor fungicide, reduced tobacco target spot caused by Rhizoctonia solani by 62%, but also affected the composition and diversity of other microbes on the surface and interior of treated tobacco leaves. High-throughput sequencing showed that the dominant bacteria prior to azoxystrobin treatment were Methylobacterium on healthy leaves and Pseudomonas on diseased leaves, and the dominant fungi were Thanatephorous (teleomorph of Rhizoctonia) and Symmetrospora on healthy leaves and Thanatephorous on diseased leaves. Both bacterial and fungal diversity significantly increased 1 to 18 days post treatment (dpt) with azoxystrobin for healthy and diseased leaves. For bacteria on healthy leaves, the relative abundance of Pseudomonas, Sphingomonas, Unidentified-Rhizobiaceae and Massilia declined, while Methylobacterium and Aureimonas increased. On diseased leaves, the relative abundance of Sphingomonas and Unidentified-Rhizobiaceae declined, while Methylobacterium, Pseudomonas and Pantoea increased. For fungi on healthy leaves, the relative abundance of Thanatephorous declined, while Symmetrospora, Sampaiozyma, Plectosphaerella, Cladosporium and Cercospora increased. On diseased leaves, the relative abundance of Thanatephorous declined, while Symmetrospora, Sampaiozyma, Plectosphaerella, Cladosporium, Phoma, Pantospora and Fusarium, increased. Compared to healthy leaves, azoxystrobin treatment of diseased leaves resulted in greater reductions in Thanatephorous, Sphingomonas and Unidentified-Rhizobiaceae, a greater increase in Methylobacterium, and similar changes in Phoma, Fusarium, Plectosphaerella and Cladosporium. Azoxystrobin had a semi-selective effect altering the microbial diversity of the tobacco leaf microbiome, which could be due to factors, such as differences among bacterial and fungal species in sensitivity to quinone outside inhibitors, ability to use nutrients and niches as certain microbes are affected, and metabolic responses to azoxystrobin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».