Reflex testing for RAS and BRAF mutations in metastatic colorectal cancer: A single Canadian academic oncology center experience.
Notice bibliographique
Résumé
86 Background: Patients with left-sided metastatic colorectal cancer (mCRC) without mutations in RAS or BRAF V600E are eligible to a combination treatment of an anti-EGFR monoclonal antibody in association with chemotherapy. This combination is associated with a survival benefit and is recommended by oncology guidelines as first line therapy for RAS/BRAF wild type left-sided mCRC patients. The CHUM (University of Montreal Hospital Center) has implemented reflex testing of RAS/BRAF mutations for mCRC since October 22nd 2019, and was one of the only hospitals in Canada to do so. With this study, we want to demonstrate that reflex testing of these mutations improves the quality of care received by patients. Methods: In this retrospective study, we reviewed pathological and clinical data of 101 patients with newly diagnosed mCRC that had their pathological diagnosis done at the CHUM. Patients diagnosed between July 1st 2017 and October 21st 2019, before implementation of reflex testing, (“Before reflex testing” group, n = 62 patients) were compared to patients diagnosed between October 22nd 2019 and December 31st 2021 (“After reflex testing” group, n = 39 patients). Results: The average delay between the mCRC biopsy and the result of the RAS/BRAF mutations was reduced to 25 days (CI95% 22.6 – 28.1) in the “After reflex testing” group, compared to 154 days (CI95% 111.2 – 202.5) in the “Before reflex testing” group. Respectively 66% (41/62) of patients in the “Before reflex testing” group and 69% (27/39) of patients in the “After reflex testing” received a systemic treatment. At initiation of systemic therapy, results of RAS/ BRAF mutations were available for 85% (35/41) of patients in the “After reflex testing” group, versus only 17% (7/41) of patients in the “Before reflex testing” group. Among patients eligible for an anti-EGFR monoclonal antibody and who received it, 100% of them (6/6) received it in the first line setting in the “After reflex testing” group, compared to 33% (3/9) in the “Before reflex testing” group. Conclusions: Our study shows that with reflex testing of RAS/ BRAF mutations, oncologists have quicker access to all relevant information to make the best treatment decision for their patients. It allows eligible patients to receive an anti-EGFR therapy in the first line setting, as recommended by oncology guidelines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».