Genomic features and heat resistance profiles of<i>Escherichia coli</i>isolated from Brazilian beef
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Characterize Escherichia coli and E. coli -producing (STEC) isolates from Brazilian beef to determine heat resistance and the presence of the transmissible locus of stress tolerance (tLST). METHODS AND RESULTS: Twenty-two STEC previously isolated from beef and characterized as STEC by PCR were subjected to different heat survival challenges (60°C and 71°C). Furthermore, the three tLST-positive isolates and one tLST-negative isolate by PCR were selected for WGS analysis. Phenotypic results indicated that 3/22 (13.64%) were heat resistant, 12/22 (54.54%) were moderately resistant, and 7/22 (31.82%) were sensitive to heat treatments. WGS analyses showed that three isolates with heat resistance showed tLST with up to 80% and 42% of similarity by BLAST analysis, with the major tLST genes being responsible for the homeostasis module. However, WGS showed the absence of stx genes associated with tLST-positive isolates, albeit with virulence and resistance genes found in extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC). CONCLUSION: Our findings demonstrate the presence of heat-resistant E. coli as well as confirm some tLST genes in E. coli isolated from Brazilian beef.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».