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Enregistrement W4318965935 · doi:10.1097/pgp.0000000000000898

Targeted Molecular Testing in Endometrial Carcinoma: Validation of a Clinically Driven Selective ProMisE Testing Protocol

2022· article· en· W4318965935 sur OpenAlexaff
Aline Talhouk, Amy Jamieson, Emma J. Crosbie, Alexandra Taylor, Derek S. Chiu, Samuel Leung, Marcel Grube, Stefan Kommoss, C. Blake Gilks, Jessica N. McAlpine, Naveena Singh

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Gynecological Pathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometrial and Cervical Cancer Treatments
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésLymphovascular invasionEndometrial cancerOncologyDNA mismatch repairImmunohistochemistryCarcinomaMicrosatellite instabilityPopulationInternal medicineLynch syndromeMedicineCancerBiologyPathologyColorectal cancerGeneMetastasisGeneticsMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Incorporation of molecular classification into clinicopathologic assessment of endometrial carcinoma (EC) improves risk stratification. Four EC molecular subtypes, as identified by The Cancer Genome Atlas, can be diagnosed through a validated algorithm Pro active M olecular R is k Classifier for E ndometrial Cancer (ProMisE) using p53 and mismatch repair (MMR) protein immunohistochemistry (IHC), and DNA polymerase epsilon ( POLE) mutational testing. Cost and access are major barriers to universal testing, particularly POLE analysis. We assessed a selective ProMisE algorithm (ProMisE-S): p53 and MMR IHC on all EC's with POLE testing restricted to those with abnormal MMR or p53 IHC (to identify POLEmut EC with secondary abnormalities in MMR and/or p53) and those with high-grade or non-endometrioid morphology, stage >IA or presence of lymphovascular space invasion (so as to avoid testing on the lowest risk tumors). We retrospectively compared the known ProMisE molecular classification to ProMisE-S in 912 EC. We defined a group of "very low-risk" EC (G1/G2, endometrioid, MMR-proficient, p53 wild-type, stage IA, no lymphovascular space invasion) in whom POLE testing will not impact on patient care; using ProMisE-S, POLE testing would not be required in 55% of biopsies and 38% of all EC's, after evaluation of the hysterectomy specimen, in a population-based cohort. "Very low-risk" endometrioid EC with unknown POLE status showed excellent clinical outcomes. Fifteen of 166 (9%) of all p53abn EC showed G1/G2 endometrioid morphology, supporting the potential value of universal p53 IHC. The addition of molecular testing changed the risk category in 89/896 (10%) EC's. In routine practice, POLE testing could be further restricted to only those patients in whom this would alter adjuvant therapy recommendations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,984

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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