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Enregistrement W4319013028 · doi:10.3390/brainsci13020254

Effects of Patchwise Sampling Strategy to Three-Dimensional Convolutional Neural Network-Based Alzheimer’s Disease Classification

2023· article· en· W4319013028 sur OpenAlexfundno aff
Xiaoqi Shen, Lan Lin, Xinze Xu, Shuicai Wu

Notice bibliographique

RevueBrain Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthServierH. Lundbeck A/SNatural Science Foundation of Beijing MunicipalityEisaiNational Natural Science Foundation of ChinaNorthern California Institute for Research and EducationBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaBiogenU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésOverfittingDiscriminative modelPattern recognition (psychology)Artificial intelligenceComputer scienceConvolutional neural networkSubnetworkContextual image classificationFeature (linguistics)Artificial neural networkRegion of interestMachine learningImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, the rapid development of artificial intelligence has promoted the widespread application of convolutional neural networks (CNNs) in neuroimaging analysis. Although three-dimensional (3D) CNNs can utilize the spatial information in 3D volumes, there are still some challenges related to high-dimensional features and potential overfitting issues. To overcome these problems, patch-based CNNs have been used, which are beneficial for model generalization. However, it is unclear how the choice of a patchwise sampling strategy affects the performance of the Alzheimer's Disease (AD) classification. To this end, the present work investigates the impact of a patchwise sampling strategy for 3D CNN based AD classification. A 3D framework cascaded by two-stage subnetworks was used for AD classification. The patch-level subnetworks learned feature representations from local image patches, and the subject-level subnetwork combined discriminative feature representations from all patch-level subnetworks to generate a classification score at the subject level. Experiments were conducted to determine the effect of patch partitioning methods, the effect of patch size, and interactions between patch size and training set size for AD classification. With the same data size and identical network structure, the 3D CNN model trained with 48 × 48 × 48 cubic image patches showed the best performance in AD classification (ACC = 89.6%). The model trained with hippocampus-centered, region of interest (ROI)-based image patches showed suboptimal performance. If the pathological features are concentrated only in some regions affected by the disease, the empirically predefined ROI patches might be the right choice. The better performance of cubic image patches compared with cuboidal image patches is likely related to the pathological distribution of AD. The image patch size and training sample size together have a complex influence on the performance of the classification. The size of the image patches should be determined based on the size of the training sample to compensate for noisy labels and the problem of the curse of dimensionality. The conclusions of the present study can serve as a reference for the researchers who wish to develop a superior 3D patch-based CNN model with an appropriate patch sampling strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,608
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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