Macromolecular crowding regulates matrix composition and gene expression in human gingival fibroblast cultures
Notice bibliographique
Résumé
Standard cell cultures are performed in aqueous media with a low macromolecule concentration compared to tissue microenvironment. In macromolecular crowding (MMC) experiments, synthetic polymeric crowders are added into cell culture media to better mimic macromolecule concentrations found in vivo. However, their effect on cultured cells is incompletely understood and appears context-dependent. Here we show using human gingival fibroblasts, a cell type associated with fast and scarless wound healing, that MMC (standard medium supplemented with Ficoll 70/400) potently modulates fibroblast phenotype and extracellular matrix (ECM) composition compared to standard culture media (nMMC) over time. MMC significantly reduced cell numbers, but increased accumulation of collagen I, cellular fibronectin, and tenascin C, while suppressing level of SPARC (Secreted Protein Acidic and Cysteine Rich). Out of the 75 wound healing and ECM related genes studied, MMC significantly modulated expression of 25 genes compared to nMMC condition. MMC also suppressed myofibroblast markers and promoted deposition of basement membrane molecules collagen IV, laminin 1, and expression of LAMB3 (Laminin Subunit Beta 3) gene. In cell-derived matrices produced by a novel decellularization protocol, the altered molecular composition of MMC matrices was replicated. Thus, MMC may improve cell culture models for research and provide novel approaches for regenerative therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».