Molecular and structural characterization of a novel high‐prevalence antigen of the Augustine blood group system
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: An antibody directed against a high-prevalence red blood cell (RBC) antigen was detected in a 67-year-old female patient of North African ancestry with a history of a single pregnancy and blood transfusion. So far, the specificity of the proband's alloantibody remained unknown in our immunohematology reference laboratory. STUDY DESIGN AND METHODS: Whole-exome sequencing (WES) was performed on the proband's DNA. The reactivity to the SLC29A1-encoded ENT1 adenosine transporter was investigated by flow cytometry analyses of ENT1-expressing HEK293 cells, and RBCs from Augustine-typed individuals. Erythrocyte protein expression level, nucleoside-binding capacity, and molecular structure of the proband's ENT1 variant were further explored by western blot, flow cytometry, and molecular dynamics calculations, respectively. RESULTS: A missense variant was identified in the SLC29A1 gene, which encodes the Augustine blood group system. It arises from homozygosity for a rare c.242A > G missense mutation that results in a nonsynonymous p.Asn81Ser substitution within the large extracellular loop of ENT1. Flow cytometry analyses demonstrated that the proband's antibody was reactive against HEK-293 cells transfected with control but not proband's SLC29A1 cDNA. Consistent with this finding, proband's antibody was found to be reactive with At(a-) (AUG:-2), but not AUG:-1 (null phenotype) RBCs. Data from structural analysis further supported that the proband's p.Asn81Ser variation does not alter ENT1 binding of its specific inhibitor NBMPR. CONCLUSION: Our study provides evidence for a novel high-prevalence antigen, AUG4 (also called ATAM after the proband's name) in the Augustine blood group system, encoded by the rare SLC29A1 variant allele AUG*04 (c.242A > G, p.Asn81Ser).
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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