Coronavirus peplomer charge heterogeneity
Notice bibliographique
Résumé
Recent advancements in viral hydrodynamics afford the calculation of the transport properties of particle suspensions from first principles, namely, from the detailed particle shapes. For coronavirus suspensions, for example, the shape can be approximated by beading (i) the spherical capsid and (ii) the radially protruding peplomers. The general rigid bead-rod theory allows us to assign Stokesian hydrodynamics to each bead. Thus, viral hydrodynamics yields the suspension rotational diffusivity, but not without first arriving at a configuration for the cationic peplomers. Prior work considered identical peplomers charged identically. However, a recent pioneering experiment uncovers remarkable peplomer size and charge heterogeneities. In this work, we use energy minimization to arrange the spikes, charged heterogeneously to obtain the coronavirus spike configuration required for its viral hydrodynamics. For this, we use the measured charge heterogeneity. We consider 20 000 randomly generated possibilities for cationic peplomers with formal charges ranging from 30 to 55. We find the configurations from energy minimization of all of these possibilities to be nearly spherically symmetric, all slightly oblate, and we report the corresponding breadth of the dimensionless rotational diffusivity, the transport property around which coronavirus cell attachment revolves.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».