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Enregistrement W4319317749 · doi:10.3390/brainsci13020260

OViTAD: Optimized Vision Transformer to Predict Various Stages of Alzheimer’s Disease Using Resting-State fMRI and Structural MRI Data

2023· article· en· W4319317749 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBrain Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésResting state fMRINeuroscienceAlzheimer's diseasePsychologyArtificial intelligenceMedicineDiseaseComputer sciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Advances in applied machine learning techniques for neuroimaging have encouraged scientists to implement models to diagnose brain disorders such as Alzheimer's disease at early stages. Predicting the exact stage of Alzheimer's disease is challenging; however, complex deep learning techniques can precisely manage this. While successful, these complex architectures are difficult to interrogate and computationally expensive. Therefore, using novel, simpler architectures with more efficient pattern extraction capabilities, such as transformers, is of interest to neuroscientists. This study introduced an optimized vision transformer architecture to predict the group membership by separating healthy adults, mild cognitive impairment, and Alzheimer's brains within the same age group (>75 years) using resting-state functional (rs-fMRI) and structural magnetic resonance imaging (sMRI) data aggressively preprocessed by our pipeline. Our optimized architecture, known as OViTAD is currently the sole vision transformer-based end-to-end pipeline and outperformed the existing transformer models and most state-of-the-art solutions. Our model achieved F1-scores of 97%±0.0 and 99.55%±0.39 from the testing sets for the rs-fMRI and sMRI modalities in the triple-class prediction experiments. Furthermore, our model reached these performances using 30% fewer parameters than a vanilla transformer. Furthermore, the model was robust and repeatable, producing similar estimates across three runs with random data splits (we reported the averaged evaluation metrics). Finally, to challenge the model, we observed how it handled increasing noise levels by inserting varying numbers of healthy brains into the two dementia groups. Our findings suggest that optimized vision transformers are a promising and exciting new approach for neuroimaging applications, especially for Alzheimer's disease prediction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,514
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle