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Enregistrement W4319432337 · doi:10.4049/jimmunol.206.supp.25.08

Cooperative ectodomain interaction among TCRαβ, CD3δɛ and CD3γɛ

2021· article· en· W4319432337 sur OpenAlexaff
Zhou Yuan, Peiwen Cong, Chenghao Ge, Aswin Natarajan, Stefano Travaglino, Michelle Krogsgaard, Cheng Zhu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNanofabrication and Lithography Techniques
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEctodomainT-cell receptorCD3ReceptorBiologyCell biologyT cellChemistryAntigenCD8BiochemistryImmunologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The T-cell receptor (TCR) complex comprises of the ligand-binding subunit TCRαβ, and the signaling subunits CD3δɛ, CD3γɛ and CD3ζζ, with the Cα/Cβ in proximity to both CD3δɛ and CD3γɛ extracellularly. Direct measurements of the ectodomain interactions had not been successful, although they are believed to be important for TCR stability and functionality. Mechanical force has been shown to modulate TCR–ligand interactions. The TCR mechanosensor hypothesis predicts that force-encoded information may transmit from pMHC to CD3 via TCR-CD3 interaction. Evaluating ectodomain interactions among TCRαβ, CD3δɛ and CD3γɛ can help elucidate the TCR triggering mechanism and further guide the design of TCR-based immunotherapy. Using two mechanical based assays, we were able to measure the weak two-dimensional (2D) affinities among ectodomains of human TCRαβ (2B4-LC13), and human CD3δɛ or CD3γɛ and showed catch bond formation where lifetimes of TCRαβ–CD3δɛ and TCRαβ–CD3γɛ bonds are prolonged by forces <15 pN. Remarkably, CD3δɛ and CD3γɛ bind TCRαβ cooperatively, forming more bonds that last longer when both CD3s interact with TCRαβ as a whole than the sum of either CD3 interacting with TCRαβ individually. Interestingly, these measurements are comparable to 2D affinity and force-dependent bond lifetime of the 2B4 TCR interaction with its cognate ligand K5:I-Ek, supporting their relevance to TCR function. Using molecular dynamics simulations based on a published Cryo-EM structure, we identified the formation of long-lasting CD3δɛ–TCRαβ–CD3γɛ trimolecular bonds as the structural mechanisms of the cooperativity. Our work helps explain TCR function under force and suggests strategies for engineering of TCR for immunotherapy applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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