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Enregistrement W4319442882 · doi:10.21203/rs.3.rs-2460278/v1

Monkeypox: A review of epidemiological modelling studies and how modelling has led to mechanistic insight

2023· review· en· W4319442882 sur OpenAlexaff
Chapin S. Korosec, Marina Banuet-Martínez, Yang Yang, Behnaz Jafari, Avneet Kaur, Zahid A Butt, Helen Chen, Svetlana Yanushkevich, Iain R. Moyles, Jane M. Heffernan

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusYork UniversityUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaOkanagan University CollegeUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonkeypoxOrthopoxvirusSmallpoxZoonosisEpidemiologyTransmission (telecommunications)Public healthBasic reproduction numberBiologyVirologyGeographyVaccinationPopulationEnvironmental healthMedicineVacciniaComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human monkeypox virus (mpox) is a viral zoonosis belonging to the Orthopoxvirus genus of the Poxviridae family that presents with similar symptoms as seen previously in human smallpox patients. mpox is a growing concern internationally with over 80000 cases in non-endemic countries as of December 2022. In this review, we briefly cover the history and origins of mpox and describe its basic virology, noting key differences in mpox viral fitness traits pre and post-2022. We then summarize and critique current knowledge from epidemiological mathematical models, within-host models, and between-host transmission models. We distinguish between models that focus on immunity from vaccination, as well as geography, climatic variables, and animal models. We report various epidemiological parameters, such as the reproduction number R0, in a condensed format for ease of comparison between studies. We focus specifically on how mathematical modelling studies have led to novel mechanistic insight into Monkeypox transmission and pathogenesis. As mpox continues to emerge and is predicted to continue to form subsequent peaks in many historically non-endemic countries, mpox mathematical modelling studies can provide rapid actionable insight into viral dynamics to guide public health measures and mitigation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,753
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,507
Tête enseignante GPT0,489
Écart entre enseignants0,018 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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