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Enregistrement W4319599236 · doi:10.3390/pathogens12020269

Movement of Chronic Wasting Disease Prions in Prairie, Boreal and Alpine Soils

2023· article· en· W4319599236 sur OpenAlexafffund
Alsu Kuznetsova, Debbie McKenzie, Bjørnar Ytrehus, Kjersti Selstad Utaaker, Judd M. Aiken

Notice bibliographique

RevuePathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Prion Research InstituteAlberta Agriculture and ForestryGenome AlbertaNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismMiljødirektoratetUniversity of AlbertaGenome Canada
Mots-clésIlliteChronic wasting diseaseSoil waterMontmorilloniteEnvironmental chemistryClay mineralsGeologyChemistrySoil scienceMineralogyPrion protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease (CWD) is a transmissible spongiform encephalopathy negatively impacting cervids on three continents. Soil can serve as a reservoir for horizontal transmission of CWD by interaction with the infectious prion protein (PrPCWD) shed by diseased individuals and from infected carcasses. We investigated the pathways for PrPCWD migration in soil profiles using lab-scale soil columns, comparing PrPCWD migration through pure soil minerals (quartz, illite and montmorillonite), and diverse soils from boreal (Luvisol, Brunisol) and prairie (Chernozem) regions. We analyzed the leachate of the soil columns by immunoblot and protein misfolding cyclic amplification (PMCA) and detected PrP in the leachates of columns composed of quartz, illite, Luvisol and Brunisol. Animal bioassay confirmed the presence of CWD infectivity in the leachates from quartz, illite and Luvisol columns. Leachates from columns with montmorillonite and prairie Chernozems did not contain PrP detectable by immunoblotting or PMCA; bioassay confirmed that the Chernozemic leachate was not infectious. Analysis of the solid phase of the columns confirmed the migration of PrP to lower layers in the illite column, while the strongest signal in the montmorillonite column remained close to the surface. Montmorillonite, the prevalent clay mineral in prairie soils, has the strongest prion binding ability; by contrast, illite, the main clay mineral in northern boreal and tundra soils, does not bind prions significantly. This suggests that in soils of North American CWD-endemic regions (Chernozems), PrPCWD would remain on the soil surface due to avid binding to montmorillonite. In boreal Luvisols and mountain Brunisols, prions that pass through the leaf litter will continue to move through the soil mineral horizon, becoming less bioavailable. In light-textured soils where quartz is a dominant mineral, the majority of the infectious prions will move through the soil profile. Local soil properties may consequently determine the efficiency of environmental transmission of CWD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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