B-GATA factors are required to repress high-light stress responses in Marchantia polymorpha and Arabidopsis thaliana
Notice bibliographique
Résumé
GATAs are evolutionarily conserved zinc-finger transcription factors from eukaryotes. In plants, GATAs can be subdivided into four classes, A – D, based on their DNA-binding domain, and into further subclasses based on additional protein motifs. B-GATAs with a so-called LLM-domain can already be found in algae, but bryophytes and angiosperms also contain B-GATAs with a HAN-domain. The angiosperm B-GATA family is expanded and can be subdivided into family members with either a HAN- or an LLM-domain. The B-GATA family in the liverwort Marchantia polymorpha and the moss Physcomitrium patens is restricted to one and four family members, respectively, and all family members contain a HAN- as well as an LLM-domain. Here, we characterize mutants of the single B-GATA from Marchantia polymorpha . We reveal that this mutant has defects in thallus growth and in gemma formation. Transcriptomic studies uncover that the B-GATA mutant displays a constitutive high-light stress response, a phenotype that we then also confirm in mutants of Arabidopsis thaliana LLM-domain B-GATAs, suggesting that the B-GATAs have a protective role towards high-light stress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».