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Enregistrement W4319655678 · doi:10.1093/brain/awad039

The clinical and genetic spectrum of autosomal-recessive <i>TOR1A</i>-related disorders

2023· article· en· W4319655678 sur OpenAlexafffund
Afshin Saffari, Tracy Lau, Homa Tajsharghi, Ehsan Ghayoor Karimiani, Ariana Kariminejad, Giovanni Zifarelli, Tipu Sultan, Mehran Beiraghi Toosi, Sahar Sedighzadeh, Victoria Mok Siu, Juan Darío Ortigoza‐Escobar, Aisha Al‐Shamsi, Shahnaz Ibrahim, Nouriya Al‐Sannaa, Walla Al‐Hertani, Sandra Whalen, Mark A. Tarnopolsky, Shahryar Alavi, Chumei Li, Debra-Lynn Day-Salvatore, Kristin M Levandoski, Emma Bedoukian, Suneeta Madan‐Khetarpal, Michaela J. Idleburg, Minal Menezes, Aishwarya Siddharth, Konrad Platzer, Henry Oppermann, Martin Smitka, Felicity Collins, Monkol Lek, Mohmmad Shahrooei, Maryam Ghavideldarestani, Isabella Herman, John Rendu, Julien Fauré, Janice Baker, Vikas Bhambhani, Laurel Calderwood, Javad Akhondian, Shima Imannezhad, Hanieh Sadat Mirzadeh, Narges Hashemi, Mohammad Doosti, Mojtaba Safi, Najmeh Ahangari, Paria Najarzadeh Torbati, Soheila Abedini, Vincenzo Salpietro, Elif Yılmaz Güleç, Safieh Eshaghian, Mohammadreza Ghazavi, Michael T Pascher, Marina Vogel, Angela Abicht, Sébastien Moutton, Ange‐Line Bruel, Claudine Rieubland, Sabina Gallati, Tim M. Strom, Hanns Lochmüller, Mohammad Hasan Mohammadi, Javeria Raza Alvi, Elaine H. Zackai, Beth Keena, Cara Skraban, Seth Berger, E. Hallie Andrew, Elham Rahimian, Michelle M. Morrow, Ingrid M. Wentzensen, Francisca Millan, Lindsay B. Henderson, Hormos Salimi Dafsari, Heinz Jungbluth, Natalia Gomez‐Ospina, Anne McRae, Merlene Peter, Danai Veltra, Nikolaos M. Marinakis, Christalena Sofocleous, Farah Ashrafzadeh, Davut Pehli̇van, Johannes R. Lemke, Judith Melki, A. Bénézit, Peter Bauer, Denisa Weis, James R. Lupski, Jan Senderek, John Christodoulou, Wendy K. Chung, Rose E. Goodchild, Amaka C Offiah, Andrés Moreno-De-Luca, Mohnish Suri, Darius Ebrahimi‐Fakhari, Henry Houlden, Reza Maroofian

Notice bibliographique

RevueBrain · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of OttawaMcMaster Children's HospitalWestern University
Organismes subventionnairesWellcome TrustNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Institutes of HealthEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftCanada Foundation for Innovation
Mots-clésMedicineDystoniaArthrogryposisArthrogryposis multiplex congenitaMicrocephalyIntellectual disabilityContext (archaeology)PenetranceMovement disordersPediatricsDiseaseGeneticsPhenotypePathologyBiologyGenePsychiatryAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the field of rare diseases, progress in molecular diagnostics led to the recognition that variants linked to autosomal-dominant neurodegenerative diseases of later onset can, in the context of biallelic inheritance, cause devastating neurodevelopmental disorders and infantile or childhood-onset neurodegeneration. TOR1A-associated arthrogryposis multiplex congenita 5 (AMC5) is a rare neurodevelopmental disorder arising from biallelic variants in TOR1A, a gene that in the heterozygous state is associated with torsion dystonia-1 (DYT1 or DYT-TOR1A), an early-onset dystonia with reduced penetrance. While 15 individuals with AMC5-TOR1A have been reported (less than 10 in detail), a systematic investigation of the full disease-associated spectrum has not been conducted. Here, we assess the clinical, radiological and molecular characteristics of 57 individuals from 40 families with biallelic variants in TOR1A. Median age at last follow-up was 3 years (0-24 years). Most individuals presented with severe congenital flexion contractures (95%) and variable developmental delay (79%). Motor symptoms were reported in 79% and included lower limb spasticity and pyramidal signs, as well as gait disturbances. Facial dysmorphism was an integral part of the phenotype, with key features being a broad/full nasal tip, narrowing of the forehead and full cheeks. Analysis of disease-associated manifestations delineated a phenotypic spectrum ranging from normal cognition and mild gait disturbance to congenital arthrogryposis, global developmental delay, intellectual disability, absent speech and inability to walk. In a subset, the presentation was consistent with foetal akinesia deformation sequence with severe intrauterine abnormalities. Survival was 71%, with higher mortality in males. Death occurred at a median age of 1.2 months (1 week-9 years), due to respiratory failure, cardiac arrest or sepsis. Analysis of brain MRI studies identified non-specific neuroimaging features, including a hypoplastic corpus callosum (72%), foci of signal abnormality in the subcortical and periventricular white matter (55%), diffuse white matter volume loss (45%), mega cisterna magna (36%) and arachnoid cysts (27%). The molecular spectrum included 22 distinct variants, defining a mutational hotspot in the C-terminal domain of the Torsin-1A protein. Genotype-phenotype analysis revealed an association of missense variants in the 3-helix bundle domain to an attenuated phenotype, while missense variants near the Walker A/B motif as well as biallelic truncating variants were linked to early death. In summary, this systematic cross-sectional analysis of a large cohort of individuals with biallelic TOR1A variants across a wide age-range delineates the clinical and genetic spectrum of TOR1A-related autosomal-recessive disease and highlights potential predictors for disease severity and survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,437
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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