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Enregistrement W4319736128 · doi:10.3920/978-90-8686-940-4_325

325. An iterative method for deregressed proof in single-step genomic BLUP and its application to a dairy cattle population

2022· article· en· W4319736128 sur OpenAlexaff
Yutaka Masuda, Z. Liu, P G Sullivan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensValacta (Canada)Ste. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBest linear unbiased predictionMathematicsExtension (predicate logic)PopulationIterative methodSelection (genetic algorithm)Matrix (chemical analysis)AlgorithmInverseStatisticsMathematical optimizationComputer scienceMedicineArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to describe an iterative algorithm to deregress genomically-enhanced breeding values (GEBV) in single-step genomic BLUP (ssGBLUP). The method is an extension of the previous work by the first two authors, who gave a deregression method in singe-step SNP BLUP. The inverse of the unified relationship matrix (H-1), which is a function of the inverse of genomic relationship matrix (G-1) and the inverse of the additive relationship matrix (A-1), was considered in the deregression method. Effective daughter contribution (ERC) for bulls or effective record contribution (ERC), which are functions of reliability of GEBV, should be used as weights on deregressed proof. The deregression algorithm consists of a series of matrix-vector multiplications, and the number of iterations is expected to be limited. The computational cost of this approach was discussed. Further research is needed to confirm the ‘reversibility’ of deregressed GEBV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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