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Enregistrement W4319986609 · doi:10.1101/2023.02.07.23285572

Heterogeneity in Preclinical Alzheimer’s Disease Trial Cohort Identified by Image-based Data-Driven Disease Progression Modelling

2023· preprint· en· W4319986609 sur OpenAlexaboutno aff
Cameron Shand, Paweł Markiewicz, David M. Cash, Daniel C. Alexander, Michael Donohue, Frederik Barkhof, Neil P. Oxtoby

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthUK Dementia Research InstituteNational Institute for Health and Care ResearchGHR FoundationAlzheimer's SocietyUniversity of Southern CaliforniaWellcome TrustUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchEngineering and Physical Sciences Research CouncilUK Research and InnovationEli Lilly and CompanyUniversity College LondonBrigham and Women's HospitalEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsAlzheimer's Association
Mots-clésAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNeuroimagingObservational studyMedicineDiseaseClinical trialInternal medicineOncologyCognitive declineDementiaPsychologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Importance Undetected biological heterogeneity adversely impacts trials in Alzheimer’s disease because rate of cognitive decline — and perhaps response to treatment — differs in subgroups. Recent results show that data-driven approaches can unravel the heterogeneity of Alzheimer’s disease progression. The resulting stratification is yet to be leveraged in clinical trials. Objective Investigate whether image-based data-driven disease progression modelling could identify baseline biological heterogeneity in a clinical trial, and whether these subgroups have prognostic or predictive value. Design Screening data from the Anti-Amyloid Treatment in Asymptomatic Alzheimer Disease (A4) Study collected between April 2014 and December 2017, and longitudinal data from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) observational study downloaded in February 2022 were used. Setting The A4 Study is an interventional trial involving 67 sites in the US, Canada, Australia, and Japan. ADNI is a multi-center observational study in North America. Participants Cognitively unimpaired amyloid-positive participants with a 3-Tesla T1-weighted MRI scan. Amyloid positivity was determined using florbetapir PET imaging (in A4) and CSF Aβ(1-42) (in ADNI). Main Outcomes and Measures Regional volumes estimated from MRI scans were used as input to the Subtype and Stage Inference (SuStaIn) algorithm. Outcomes included cognitive test scores and SUVr values from florbetapir and flortaucipir PET. Results We included 1,240 Aβ+ participants (and 407 Aβ− controls) from the A4 Study, and 731 A4-eligible ADNI participants. SuStaIn identified three neurodegeneration subtypes — Typical, Cortical, Subcortical — comprising 523 (42%) individuals. The remainder are designated subtype zero (insufficient atrophy). Baseline PACC scores (A4 primary outcome) were significantly worse in the Cortical subtype (median = -1.27, IQR=[-3.34,0.83]) relative to both subtype zero (median=-0.013, IQR=[-1.85,1.67], P<.0001) and the Subcortical subtype (median=0.03, IQR=[-1.78,1.61], P=.0006). In ADNI, over a four-year period (comparable to A4), greater cognitive decline in the mPACC was observed in both the Typical (−0.23/yr; 95% CI, [-0.41,-0.05]; P=.01) and Cortical (−0.24/yr; [-0.42,-0.06]; P=.009) subtypes, as well as the CDR-SB ( Typical : +0.09/yr, [0.06,0.12], P<.0001; and Cortical : +0.07/yr, [0.04,0.10], P<.0001). Conclusions and Relevance In a large secondary prevention trial, our image-based model detected neurodegenerative heterogeneity predictive of cognitive heterogeneity. We argue that such a model is a valuable tool to be considered in future trial design to control for previously undetected variance. Key Points Question Can MRI-based computational subtypes of preclinical neurodegeneration predict cognitive outcomes? Findings In this cross-sectional analysis of magnetic resonance imaging (MRI) data at screening (pre-randomization) in the preclinical Anti-Amyloid Treatment in Asymptomatic Alzheimer disease (A4) Study, we detected considerable neurodegenerative heterogeneity using data-driven disease progression modelling. The MRI-based computational subtypes identified by Subtype and Stage Inference (SuStaIn) differed in baseline cognitive test scores (A4) and in longitudinal cognitive decline (ADNI), with sufficient heterogeneity to potentially obscure treatment effect in A4 trial outcomes. Meaning Data-driven disease progression modelling of screening MRI scans can predict heterogeneity in cognitive performance/decline and potentially reduce heterogeneity in future clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,127
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,169
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,671

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1270,169
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,216
Tête enseignante GPT0,459
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission1
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