Revealing chirality of biological structures using different polarimetric SHG microscopy techniques
Notice bibliographique
Résumé
Polarimetric second harmonic generation (SHG) microscopy techniques are powerful tools to reveal sub-molecular information from biological specimens. Among biological samples collagen with a noncentrosymmetric structure and efficient SHG conversion has been the focus of many studies. Since collagen remodeling takes place due to cancer progression, it is important to develop tools to detect and understand the ultrastructural changes in collagen assembly using polarimetric nonlinear microscopy. Several polarimetric techniques have been developed to probe susceptibility ratios, in-plane orientation, and out of the image plane orientation of collagen. Polarization-In Polarization-Out (PIPO) and SHG circular dichroism (SHG-CD) techniques have been used to calculate the out of the image plane orientation and chirality of collagen. In this work, we study the correlation between SHG-CD and the chiral susceptibility ratio (C) in order to reveal the collagen chirality, and the collagen fiber tilt out of image plane. A numerical modeling is used to understand the relation between aforementioned parameters and the chirality and out of the image plane orientation of collagen. The results of numerical modeling show similar behaviors for SHG-CD and the chiral susceptibility ratio (C) calculated from PIPO measurements. The results obtained from rat tail tendon collagen confirms that the sign of both SHG-CD and C ratio changes by flipping the sample as it is predicted by the numerical modeling. The results also show that both SHG-CD and C ratio may become miscalculated when antiparallel chiral fibers are present in the focal volume of the microscope. The results of this study confirm that polarimetric SHG microscopy techniques are able to reveal 3D structure of biological samples and therefore they are beneficial to the diagnosis of collagen related diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».