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Enregistrement W4320074717 · doi:10.1117/12.2621489

Investigation of melanoma tissue with nonlinear multimodal polarimetric microscopy using texture analysis and machine learning

2022· article· en· W4320074717 sur OpenAlexaff
Martynas Riauka, Viktoras Mažeika, Mykolas Mačiulis, Lukas Kontenis, Edvardas Žurauskas, Mehdi Alizadeh, Kamdin Mirsanaye, Virginijus Barzda

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolarimetrySecond-harmonic generationMueller calculusMaterials scienceArtificial intelligenceMicroscopyOpticsExtracellular matrixPolarization (electrochemistry)Biological systemBiomedical engineeringComputer scienceScatteringChemistryPhysicsMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Development and metastasis of cancer are known to change the structure of extracellular matrix (ECM), which affect the tumor's further growth and spread. A substantial part of ECM is comprised of collagen, which is a noncentrosymmetric structure. As a result, it generates second harmonic signals, dependent on the polarization of incoming light. This property of collagen led to the applications of polarization-resolved second-harmonic generation (P-SHG) microscopy in investigating collagen ultrastructure changes in different cancers. In this work, multiphoton absorption fluorescence (MPF), third-harmonic generation (THG) and polarimetric second-harmonic generation (P-SHG) measurements were performed on various types and staging of human melanoma histological sections. Reduced polarimetry techniques, employing linear and circular polarization states, were used to obtain polarimetric SHG parameters of collagen in both normal and cancerous tissues. These parameters provide important information about the structural properties of collagen. The parameter distributions were analyzed using a grey-level co-occurrence matrix (GLCM), which allows to obtain statistical parameters, such as correlation, contrast, entropy, angular second moment and inverse difference moment. Statistical tests were performed on polarimetric and texture analysis data in order to determine whether parameter distribution differences in normal and cancerous tissues are statistically significant. Furthermore, a machine learning classifier algorithm was trained to distinguish normal tissues from cancerous using aforementioned polarimetric and texture parameters as predictors. Firstly, separate training and testing datasets were formed from each sample and classification was carried out for each of them individually and afterwards, a common training dataset was used for all samples. The results suggest that normal and cancerous skin tissues can be distinguished from each other with the help of multimodal nonlinear polarimetric microscopy. Also, depending on the type and stage of melanoma, the differences in some polarimetric and texture parameters are more pronounced, suggesting its possible application in melanoma diagnostics and differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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