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Enregistrement W4320473013 · doi:10.1039/bk9781849738958-00230

Computer Simulation Techniques for Modelling Statics and Dynamics of Nanoscale Structures

2014· book-chapter· en· W4320473013 sur OpenAlexaff
David A. Pink, M. Shajahan G. Razul, T.J. Gordon, Bonnie Quinn, Adam J. MacDonald

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typebook-chapter
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProteins in Food Systems
Établissements canadiensUniversity of GuelphSt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStatistical physicsMicroscale chemistryDissipative particle dynamicsComputer scienceGranularityScale (ratio)Lattice Boltzmann methodsStaticsMolecular dynamicsDissipative systemPhysicsClassical mechanicsMathematicsMechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter describes computer simulation techniques that are used to model the statics and dynamics of nanoscale structures and their self-organized assemblies via their physical interactions. We describe some models which cannot be enabled without employing computer simulation but do not explicitly address models such as self-consistent field approaches or DLVO theory. The chapter is divided into four sections: introduction and background, atomic scale molecular dynamics, coarse-grained modelling and stochastic processes, and fluid flow. It is introduced via brief descriptions of protein folding and crystalline microscale structures in edible oils. A brief background to important aspects of statistical mechanics is followed by a description of atomic scale molecular dynamics. The spatial scale is then expanded and coarse-graining of atomic interactions is described. This leads into nanoscale systems and stochastic processes, and we describe the various applications of Monte Carlo techniques. The fourth section deals with fluid flow and we describe dissipative particle dynamics and, to a lesser extent, lattice-Boltzmann theory. In all sections we give steps to follow (recipes) in using these techniques. In addition, we give one or two examples of modelling and how computer simulation was used. Although our choices of methods and examples reflect our principal interests, we are not pushing for the use of one technique rather than another. We describe techniques which either continue to play fundamental roles in computer simulation of soft matter and fluids or are newer developments which have shown increased use in the last decade.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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