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Enregistrement W4320719527 · doi:10.1101/2023.02.10.23285708

Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential Status is Associated with Left Main Artery Stenosis

2023· preprint· en· W4320719527 sur OpenAlexaff
J. Brett Heimlich, Michael A. Raddatz, John A. Wells, Caitlyn Vlasschaert, Sydney Olson, Marcus Threadcraft, Kristoff Foster, Emmanuel Boateng, Kelsey Umbarger, Yan Ru Su, Dan M. Roden, Colin M. Barker, Alexander G. Bick

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineCoronary artery diseaseCardiologyStenosisOdds ratioCardiac catheterizationLogistic regressionBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) occurs as a result of acquired mutations in bone marrow progenitor cells. CHIP confers a twofold risk of atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD). However, there is limited data regarding specific cardiovascular phenotypes in this population. We recruited patients from the Vanderbilt University Medical Center cardiac catheterization laboratory and performed next generation sequencing to determine CHIP status. Multivariable logistic regression models and proportional odds models were used to assess the association between CHIP status and coronary angiography. We find nearly 1 in 5 patients undergoing coronary angiography have a CHIP mutation. Those with CHIP had a higher risk of having left main coronary artery disease compared to non-CHIP carriers. We additionally find that those with a specific CHIP mutation, ten eleven translocase 2 (TET2) has a larger effect size on left main stenosis compared with other CHIP mutations. This is the first description of a specific atherosclerotic phenotype in CHIP and serves as a basis for understanding enhanced morbidity and mortality in CHIP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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