A Mitosome With Distinct Metabolism in the Uncultured Protist Parasite<i>Paramikrocytos canceri</i>(Rhizaria, Ascetosporea)
Notice bibliographique
Résumé
Ascetosporea are endoparasites of marine invertebrates that include economically important pathogens of aquaculture species. Owing to their often-minuscule cell sizes, strict intracellular lifestyle, lack of cultured representatives and minimal availability of molecular data, these unicellular parasites remain poorly studied. Here, we sequenced and assembled the genome and transcriptome of Paramikrocytos canceri, an endoparasite isolated from the European edible crab Cancer pagurus. Using bioinformatic predictions, we show that P. canceri likely possesses a mitochondrion-related organelle (MRO) with highly reduced metabolism, resembling the mitosomes of other parasites but with key differences. Like other mitosomes, this MRO is predicted to have reduced metabolic capacity and lack an organellar genome and function in iron-sulfur cluster (ISC) pathway-mediated Fe-S cluster biosynthesis. However, the MRO in P. canceri is uniquely predicted to produce ATP via a partial glycolytic pathway and synthesize phospholipids de novo through the CDP-DAG pathway. Heterologous gene expression confirmed that proteins from the ISC and CDP-DAG pathways retain mitochondrial targeting sequences that are recognized by yeast mitochondria. This represents a unique combination of metabolic pathways in an MRO, including the first reported case of a mitosome-like organelle able to synthesize phospholipids de novo. Some of these phospholipids, such as phosphatidylserine, are vital in other protist endoparasites that invade their host through apoptotic mimicry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».