MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4320913071 · doi:10.1038/s41586-022-05633-w

The case for standardizing gene nomenclature in vertebrates

2023· letter· en· W4320913071 sur OpenAlexaff
Fiona McCarthy, Tamsin E. M. Jones, Anne E. Kwitek, Cynthia L. Smith, Peter D. Vize, Monte Westerfield, Elspeth A. Bruford

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Food and AgricultureNational Institutes of HealthWellcome TrustEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentU.S. Department of AgricultureHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésNomenclatureGene nomenclatureGeneBiologyComputational biologyEvolutionary biologyGeneticsZoologyTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Standardized gene nomenclature supports unambiguous communication and identification of the scientific literature associated with genes; to support the increasing number of annotated genomes that are now available for comparative studies, gene nomenclature authorities coordinate the assignment of approved gene names that can be readily applied across species. Theofanopoulou et al. 1 propose a new nomenclature for the genes that encode oxytocin and arginine vasopressin and their receptors. Rather than changing to a different nomenclature, we suggest minor updates to the current approved nomenclature of these vertebrate genes to better reflect their evolutionary history. We call on authors, journal editors and reviewers to help support communication and indexing of gene-related publications by working with existing gene nomenclature committees and ensuring that standardized gene nomenclature is routinely used.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,221
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNatureMême sujetAnimal Genetics and ReproductionTravaux en français237 207