MOLECULAR CHARACTERIZATION OF COLD TOLERANT GERMPLASM OF PHASEOLUS BEANS WITH SEQUENCE RELATED AMPLIFIED POLYMORPHISM (SRAP) AND RETROTRANSPOSON-BASED INTERPRIMER BINDING SITES (iPBS) MARKERS
Notice bibliographique
Résumé
In this study genetic diversity of 55 Phaseolus sp. beans selected for cold tolerance from different regions of Türkiye was investigated by using sequence related amplified polymorphism (SRAP) and retrotransposon-based interprimer binding sites (iPBS)markers. Four commercially registered cultivars, one accession of Phaseolus coccineus and a tepary bean Phaseaolus acutifolius species were included for comparison. Genomic DNA was isolated from young fresh leaves and PCR reaction was carried out using 30 SRAP (sequence related amplified polymorphism) and 12 iPBS (retrotransposon-based interprimer binding sites) primers. Similarity analyses were performed and dendrograms were produced according to the Unweighted Pair-Group Mean Arithmetic method (UPGMA). In PCR reactions, 331 total and 146 polymorphic bands were produced with 30 SRAP primer combinations. The number of polymorphic bands ranged between 1 and 12 with an average 4.86 polymorphic marker for each primer pair. Twelve iPBS primers produced 156 total bands and 72 of them were polymorphic. The highest polymorphism was obtained with SRAP primer combinations of Me8Em3 and Me7Em14 and iPBS primers 2270, 2394 and 2252. Characterization of germplasm with SRAP and iPBS primers was discussed in relation to cold tolerance, species, source, seed size, seed color and growth type. In conclusion, genetic variability of germplasm of 55 Phaseolus bean species, genotypes and cultivars selected for cold tolerance were effectively assessed by PCR based molecular techniques, SRAP and iPBS. High levels of polymorphism determined in the core collection may be used in breeding programs for the development of cold tolerant superior cultivars. Key words: Phaseolus sp. Beans, Chilling Tolerance, Landraces, Genetic Diversity
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».